More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6039 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1359  hypothetical protein  43.5 
 
 		 1146 aa  746    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6039  SNF2 family DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1010 aa  2062    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003242  helicase putative  42.42 
 
 		 1149 aa  753    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3788  SNF2-related protein  41.24 
 
 		 1148 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  33.52 
 
 		 1075 aa  329  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  37.1 
 
 		 1248 aa  313  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  31.8 
 
 		 1131 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4264  SNF2-related protein  36.45 
 
 		 1259 aa  286  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0282  SNF2 family helicase  35.27 
 
 		 1080 aa  284  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4615  non-specific serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 		 1082 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916541  hitchhiker  0.0000304153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  32.78 
 
 		 1291 aa  270  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1068  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1128 aa  256  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3307  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 		 1033 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.834499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 1074 aa  208  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 		 933 aa  207  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  31.9 
 
 		 1185 aa  207  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 		 925 aa  207  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  29.8 
 
 		 924 aa  206  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  29.68 
 
 		 918 aa  205  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  29.84 
 
 		 918 aa  205  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  30.32 
 
 		 918 aa  205  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 		 918 aa  204  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  29.26 
 
 		 918 aa  204  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  29.15 
 
 		 918 aa  204  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  29.15 
 
 		 918 aa  204  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  29.31 
 
 		 918 aa  204  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  29.26 
 
 		 918 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  29.26 
 
 		 918 aa  204  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 918 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 1050 aa  202  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 1007 aa  199  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  30.49 
 
 		 1048 aa  198  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  32.42 
 
 		 901 aa  196  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  31.36 
 
 		 1072 aa  194  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 		 898 aa  193  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  31.7 
 
 		 1040 aa  193  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  27.54 
 
 		 1175 aa  192  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  30.99 
 
 		 1065 aa  192  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 		 1021 aa  191  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 1028 aa  190  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  31.24 
 
 		 917 aa  188  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.53 
 
 		 1026 aa  188  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 		 876 aa  188  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  28.54 
 
 		 1354 aa  188  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  30.41 
 
 		 902 aa  188  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  31.35 
 
 		 1007 aa  188  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.82 
 
 		 1099 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 1029 aa  187  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  26.21 
 
 		 1193 aa  187  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  29.33 
 
 		 1194 aa  186  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  30.35 
 
 		 621 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  29.9 
 
 		 1006 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 1152 aa  185  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  32.81 
 
 		 773 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  31.69 
 
 		 1078 aa  184  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  30.54 
 
 		 1063 aa  184  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  31.55 
 
 		 931 aa  184  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 		 1112 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  31.77 
 
 		 777 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  32.81 
 
 		 663 aa  183  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 		 1139 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 		 982 aa  182  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 		 1082 aa  182  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  30.06 
 
 		 1071 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  29.84 
 
 		 1069 aa  181  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  29.29 
 
 		 891 aa  181  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  29.91 
 
 		 1069 aa  181  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  30.21 
 
 		 990 aa  180  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 		 1047 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  30.24 
 
 		 1019 aa  180  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  30.31 
 
 		 1068 aa  180  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  31.48 
 
 		 991 aa  180  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  31.98 
 
 		 1047 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  29.63 
 
 		 1178 aa  180  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 		 1104 aa  179  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 		 1055 aa  179  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  30.27 
 
 		 899 aa  178  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.55 
 
 		 1067 aa  178  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 1091 aa  178  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  29.7 
 
 		 1125 aa  177  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  30.74 
 
 		 914 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  28.31 
 
 		 1161 aa  177  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  29.28 
 
 		 886 aa  177  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  28.23 
 
 		 1023 aa  177  9e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.75 
 
 		 1143 aa  176  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  32.03 
 
 		 872 aa  177  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 		 633 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.49 
 
 		 977 aa  177  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  28.92 
 
 		 1087 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  31.9 
 
 		 896 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  29.74 
 
 		 1033 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  31.07 
 
 		 1209 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 1068 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 		 1068 aa  176  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 		 1048 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  31.2 
 
 		 1100 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  31.4 
 
 		 903 aa  176  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 		 1108 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  29.37 
 
 		 1019 aa  175  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  30.72 
 
 		 918 aa  175  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>