More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1672 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  76.01 
 
 
497 aa  794    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  71.77 
 
 
498 aa  730    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  71.37 
 
 
498 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  75.81 
 
 
497 aa  793    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  76.72 
 
 
504 aa  790    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  75.25 
 
 
494 aa  780    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  80.65 
 
 
496 aa  834    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  100 
 
 
544 aa  1107    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  97.78 
 
 
496 aa  990    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  76.61 
 
 
497 aa  797    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  77.02 
 
 
497 aa  799    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  58.7 
 
 
501 aa  599  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  59.47 
 
 
492 aa  596  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  58.5 
 
 
495 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  57.14 
 
 
497 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  56.39 
 
 
521 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  50.5 
 
 
493 aa  492  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  51.21 
 
 
497 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.58 
 
 
534 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.11 
 
 
499 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  48.58 
 
 
491 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  48.8 
 
 
496 aa  445  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  46.42 
 
 
490 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  46.76 
 
 
495 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  44.4 
 
 
497 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  44.04 
 
 
494 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  42.45 
 
 
496 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  42.45 
 
 
496 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  41.27 
 
 
486 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  40.4 
 
 
496 aa  373  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  38.72 
 
 
532 aa  363  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  42.08 
 
 
502 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  40.08 
 
 
490 aa  362  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  38.32 
 
 
535 aa  360  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  38.31 
 
 
549 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  38.25 
 
 
494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  37 
 
 
498 aa  331  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  38.94 
 
 
556 aa  327  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.64 
 
 
551 aa  326  8.000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  37.57 
 
 
556 aa  318  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  35.1 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  36.14 
 
 
492 aa  311  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  34.02 
 
 
578 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  34.58 
 
 
474 aa  274  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  51.93 
 
 
288 aa  243  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  50.43 
 
 
609 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  52.36 
 
 
267 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  52.36 
 
 
267 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  50.21 
 
 
270 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  49.36 
 
 
270 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  50.22 
 
 
270 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  49.36 
 
 
270 aa  229  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  49.36 
 
 
270 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  49.36 
 
 
270 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  49.36 
 
 
254 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  49.36 
 
 
254 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  47.74 
 
 
259 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  54.69 
 
 
270 aa  220  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  48.92 
 
 
308 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  45.23 
 
 
258 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  47 
 
 
261 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  46.64 
 
 
264 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  50 
 
 
263 aa  199  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  42.42 
 
 
279 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  40.18 
 
 
262 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  39.02 
 
 
307 aa  181  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  38.16 
 
 
289 aa  173  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  37.34 
 
 
294 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  42.13 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  37.04 
 
 
263 aa  167  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  38.46 
 
 
256 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  38.77 
 
 
318 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  37.28 
 
 
294 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  38.33 
 
 
294 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  38.5 
 
 
375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  39.35 
 
 
303 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  41.4 
 
 
329 aa  166  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  38.33 
 
 
294 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  38.79 
 
 
269 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  38.91 
 
 
285 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  38.57 
 
 
365 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  38.43 
 
 
296 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  41.94 
 
 
405 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  35.94 
 
 
314 aa  161  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  40.18 
 
 
327 aa  161  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  34.34 
 
 
340 aa  161  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  39.35 
 
 
300 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  39.09 
 
 
337 aa  160  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  38.46 
 
 
310 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  39.15 
 
 
304 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  40.76 
 
 
297 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  35.65 
 
 
293 aa  160  6e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3677  hypothetical protein  39.09 
 
 
274 aa  160  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  40.87 
 
 
314 aa  160  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  37.96 
 
 
393 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  37.44 
 
 
305 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  39.62 
 
 
304 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0718  protein of unknown function DUF344  39.2 
 
 
260 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal  0.613775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  38.74 
 
 
298 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  36.57 
 
 
369 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>