183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1326 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  98.51 
 
 
471 aa  925    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  937    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  66.59 
 
 
455 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  66.67 
 
 
455 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  66.67 
 
 
455 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  66.88 
 
 
454 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  65.17 
 
 
459 aa  595  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  63.4 
 
 
457 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  64.98 
 
 
457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  47.11 
 
 
484 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  41.5 
 
 
504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  37.24 
 
 
470 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  38.48 
 
 
487 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  37 
 
 
479 aa  312  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  39.66 
 
 
470 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.39 
 
 
456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  41.4 
 
 
470 aa  309  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  37.58 
 
 
461 aa  309  8e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.92 
 
 
512 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  37.5 
 
 
491 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.48 
 
 
457 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  37.27 
 
 
489 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  35.28 
 
 
451 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  37.39 
 
 
472 aa  275  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.23 
 
 
465 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  38.83 
 
 
479 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  35.99 
 
 
456 aa  256  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  33.06 
 
 
511 aa  254  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  36.73 
 
 
456 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.71 
 
 
459 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  36.17 
 
 
458 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  34.3 
 
 
530 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.43 
 
 
460 aa  242  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  34.75 
 
 
460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  35.32 
 
 
518 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  31.25 
 
 
489 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  28.76 
 
 
450 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  31.26 
 
 
461 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  27.06 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.18 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  27.45 
 
 
433 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  27.87 
 
 
433 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  25.55 
 
 
446 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  25.55 
 
 
446 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  27.66 
 
 
433 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  27.45 
 
 
433 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  27.66 
 
 
433 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  27.66 
 
 
433 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  27.23 
 
 
433 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  27.02 
 
 
433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  28.82 
 
 
469 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.57 
 
 
560 aa  148  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.93 
 
 
464 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  28.16 
 
 
464 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.16 
 
 
464 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.08 
 
 
455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.63 
 
 
489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.08 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  26.78 
 
 
464 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  26.55 
 
 
520 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  29.94 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  26.56 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  27.37 
 
 
483 aa  126  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.22 
 
 
464 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  29.14 
 
 
490 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  29.09 
 
 
484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  27.75 
 
 
474 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  26.74 
 
 
486 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  26.26 
 
 
507 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  27.14 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.34 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  27.19 
 
 
488 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  27.07 
 
 
495 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.29 
 
 
369 aa  106  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  27.55 
 
 
397 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  26.73 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  22.81 
 
 
381 aa  87  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  22.44 
 
 
394 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  25.3 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.48 
 
 
382 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  24.5 
 
 
371 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.06 
 
 
851 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.19 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  20.39 
 
 
410 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  23.33 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.4 
 
 
850 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.41 
 
 
843 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  20.39 
 
 
405 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  35.51 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.22 
 
 
850 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.22 
 
 
849 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  23.45 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  20.62 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.9 
 
 
842 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  25.19 
 
 
783 aa  70.5  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  23.29 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  23.33 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  25.12 
 
 
844 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.63 
 
 
850 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  18.93 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>