More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0935 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 
370 aa  733    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  94.05 
 
 
370 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  79.73 
 
 
370 aa  591  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  75.41 
 
 
368 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  76.28 
 
 
368 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  75.41 
 
 
368 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  57.38 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  56.83 
 
 
370 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  58.58 
 
 
371 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  55.74 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  56.68 
 
 
371 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  57.77 
 
 
371 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  57.77 
 
 
371 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  57.22 
 
 
371 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  56.68 
 
 
371 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  56.4 
 
 
371 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.77 
 
 
369 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.38 
 
 
374 aa  343  4e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.94 
 
 
372 aa  339  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.04 
 
 
372 aa  328  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.59 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.07 
 
 
371 aa  322  8e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.96 
 
 
370 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.67 
 
 
380 aa  311  7.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.65 
 
 
389 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2228  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.98 
 
 
440 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.48 
 
 
443 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
290 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
288 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  47.06 
 
 
450 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
298 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  34.06 
 
 
287 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
284 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1572  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.59 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  32.12 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 
277 aa  96.3  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
287 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
291 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
283 aa  95.9  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
291 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
291 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
290 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
246 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 
253 aa  94  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
276 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
291 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
277 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
316 aa  93.2  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
289 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.55 
 
 
288 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
298 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
286 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
275 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
275 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
275 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
258 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
290 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.25 
 
 
283 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1026  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  50.57 
 
 
450 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
289 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  28.17 
 
 
278 aa  89.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
284 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.88 
 
 
398 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  32.37 
 
 
279 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 
266 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0317  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.43 
 
 
99 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
314 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  31.68 
 
 
266 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
309 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 
250 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
278 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
277 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 
260 aa  87.4  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
290 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
291 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.24 
 
 
293 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
288 aa  87  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.24 
 
 
293 aa  87  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 
270 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.24 
 
 
288 aa  87  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
288 aa  87  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.24 
 
 
293 aa  87  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
311 aa  87  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.24 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  27.24 
 
 
293 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
312 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  30.19 
 
 
271 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 
279 aa  86.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
279 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  29.82 
 
 
286 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
286 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
285 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>