More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1845 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  98.25 
 
 
229 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  96.51 
 
 
229 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  89.52 
 
 
229 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  82.97 
 
 
229 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  78.51 
 
 
229 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  77.73 
 
 
229 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  76.32 
 
 
229 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  75.98 
 
 
229 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  73.68 
 
 
229 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  68 
 
 
237 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  59.65 
 
 
252 aa  290  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  61.88 
 
 
230 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  55.56 
 
 
229 aa  258  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.33 
 
 
238 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 
231 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 
231 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
233 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.29 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 
232 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 
248 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 
248 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 
233 aa  141  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.01 
 
 
235 aa  141  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.37 
 
 
253 aa  85.5  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  26.43 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.52 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.12 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  29.66 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.45 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.35 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  28.44 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31 
 
 
257 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.32 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.18 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.79 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.88 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.11 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  26.76 
 
 
654 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.23 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  23.4 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  23.4 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.69 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.67 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.28 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.04 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2765  short chain enoyl-CoA hydratase  28.5 
 
 
274 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.54 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  29.95 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.67 
 
 
257 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.04 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
260 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  27.98 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  34.59 
 
 
702 aa  62  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.1 
 
 
253 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  28.79 
 
 
275 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.94 
 
 
261 aa  61.6  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.88 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.18 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.25 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.56 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.16 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.51 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3890  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.31 
 
 
711 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0297605  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.7 
 
 
258 aa  59.3  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.17 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  30.1 
 
 
275 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  26.49 
 
 
268 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.88 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.11 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.51 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1759  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.41 
 
 
692 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.232117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.11 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12770  Enoyl-CoA hydratase  31.48 
 
 
260 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.03 
 
 
264 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  26.84 
 
 
268 aa  58.9  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 
270 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.39 
 
 
273 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  25.81 
 
 
260 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.37 
 
 
279 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.22 
 
 
253 aa  58.5  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.18 
 
 
269 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.48 
 
 
260 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.12 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3731  short chain enoyl-CoA hydratase  27.69 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.54 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  29.32 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.64 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3658  short chain enoyl-CoA hydratase  27.69 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.66 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>