More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1096 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 285 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  94.39 
 
 		 285 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  92.98 
 
 		 285 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  81.05 
 
 		 285 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  57.39 
 
 		 295 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  57.39 
 
 		 295 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  53.17 
 
 		 301 aa  290  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09871  phosphatidate cytidylyltransferase  54.87 
 
 		 304 aa  288  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  52.63 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  53.52 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  45.36 
 
 		 290 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  43.21 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  45.2 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  45.2 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  43.81 
 
 		 304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  45.1 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  34.35 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47250  predicted protein  33.89 
 
 		 574 aa  137  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  34.03 
 
 		 267 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  33.57 
 
 		 267 aa  128  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  32.99 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  31.07 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  37.18 
 
 		 263 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  45.26 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  29.18 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.73 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  48.15 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  31.99 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  42.25 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  38.5 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  41.21 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  32.98 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  54.63 
 
 		 275 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  47.32 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  36.11 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  43.84 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  31.12 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  43.07 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 		 211 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  37.04 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  46.96 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  36.57 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  46.96 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  36.92 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  37.79 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  39.77 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  31.44 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  40.6 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  40.6 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  30.85 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  44.27 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  37.04 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  35.68 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  31.91 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  34.07 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 		 475 aa  102  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  33.33 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  50.41 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0209  phosphatidate cytidylyltransferase  46.77 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.809934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  35.53 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  32.31 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.35 
 
 		 368 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  49.57 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  30.71 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  40.64 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  49.59 
 
 		 216 aa  101  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  51.43 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  53.21 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  45.79 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  45.79 
 
 		 249 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>