More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0900 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_09611  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  91.64 
 
 
383 aa  673    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09591  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  89.56 
 
 
383 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
383 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.510844  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09821  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  69.19 
 
 
383 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1402  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.07 
 
 
392 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484993  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1085  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.42 
 
 
392 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15231  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.12 
 
 
392 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.9 
 
 
391 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08611  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.91 
 
 
392 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169143 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09801  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.9 
 
 
391 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0886  histidyl-tRNA synthetase 2  22.77 
 
 
404 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151754  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0813  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.81 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.493486  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0985  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.47 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0965259  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.81 
 
 
401 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0509  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.28 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1354  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.35 
 
 
407 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1384  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.35 
 
 
407 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 
431 aa  86.7  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.46 
 
 
392 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.83 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4683  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  28.42 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.416531 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  24.93 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  24.77 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  24.21 
 
 
470 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  25.68 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  24.1 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.05 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_750  histidyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.878399  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0615  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  22.36 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.542186  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.97 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  25.42 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  23.55 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  22.91 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.97 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  20.8 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  24.42 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  23.12 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  24.91 
 
 
538 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  23.84 
 
 
421 aa  67  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  28.02 
 
 
387 aa  67  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  21.71 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.76 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.69 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.69 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 
456 aa  66.2  0.0000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0830  histidyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 
428 aa  65.5  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.76 
 
 
420 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.85 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.15 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1093  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.79 
 
 
389 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.85 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 
408 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.54 
 
 
418 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1824  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.89 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1335  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.89 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.12 
 
 
420 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2345  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.89 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2217  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.89 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00641952  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  22.9 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0072  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.89 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1096  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.89 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  23.01 
 
 
401 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1206  ATP phosphoribosyltransferase  23.95 
 
 
326 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2681  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  25 
 
 
383 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  24.44 
 
 
383 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  22.77 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  22.44 
 
 
410 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  21.35 
 
 
421 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0442  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.85 
 
 
393 aa  63.2  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  20.19 
 
 
423 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  21.58 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 
411 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  19.25 
 
 
494 aa  63.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  20.81 
 
 
438 aa  62.8  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  23.87 
 
 
525 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0289  histidyl-tRNA synthetase  20.6 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2179  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.63 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  22.62 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  21.82 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  22.85 
 
 
427 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  21.36 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2376  histidyl-tRNA synthetase  24.6 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.95 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  22.92 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  19.1 
 
 
500 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>