More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1206 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1206  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
326 aa  673    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.54 
 
 
420 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.92 
 
 
420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.99 
 
 
420 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.99 
 
 
420 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.02 
 
 
420 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.99 
 
 
420 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.71 
 
 
420 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.99 
 
 
420 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.99 
 
 
420 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.3 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  31.86 
 
 
419 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  30.99 
 
 
380 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.96 
 
 
418 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  32.91 
 
 
389 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  32.67 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.21 
 
 
445 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.57 
 
 
438 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.18 
 
 
428 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  28.91 
 
 
449 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.72 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.76 
 
 
440 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.81 
 
 
429 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.23 
 
 
440 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.06 
 
 
394 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 
421 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.61 
 
 
438 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  28.75 
 
 
421 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.75 
 
 
434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  28.09 
 
 
383 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1555  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  26.69 
 
 
535 aa  113  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
417 aa  112  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  25.95 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 
427 aa  109  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  25.48 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2173  tRNA synthetase class II (G H P and S)  28.3 
 
 
375 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 
554 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 
419 aa  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1335  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.62 
 
 
318 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.56 
 
 
383 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0442  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.24 
 
 
393 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2531  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.35 
 
 
383 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020462  hitchhiker  0.00000966794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1605  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.35 
 
 
383 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344405  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1161  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.87 
 
 
387 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.95 
 
 
389 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1264  histidyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 
349 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.04 
 
 
413 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2244  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.53 
 
 
382 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.682852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  27.9 
 
 
401 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2692  histidyl-tRNA synthetase 2  27 
 
 
349 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1410  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.66 
 
 
383 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  hitchhiker  0.00000255449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2599  Histidine--tRNA ligase  27 
 
 
349 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1069  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.54 
 
 
387 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1433  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  27.06 
 
 
384 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239376  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  27.5 
 
 
415 aa  102  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1563  tRNA synthetase class II (G H P and S)  24.46 
 
 
400 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1888  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.46 
 
 
400 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2179  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.73 
 
 
382 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1282  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  27.76 
 
 
387 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1180  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  27.1 
 
 
382 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.869352  normal  0.414984 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2217  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.59 
 
 
382 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00641952  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1100  histidyl-tRNA synthetase 2  26.77 
 
 
382 aa  99.4  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0675  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.36 
 
 
387 aa  99  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1335  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128033  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1824  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2345  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0072  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2097  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.24 
 
 
383 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1096  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1225  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.08 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00306433  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  24.76 
 
 
538 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
430 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2975  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.56 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0747  Histidine--tRNA ligase  28.62 
 
 
386 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000807665  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1472  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.87 
 
 
382 aa  96.3  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.573457  normal  0.256348 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1826  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.85 
 
 
382 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6277  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.85 
 
 
382 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1802  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.85 
 
 
382 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 
418 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2834  histidyl-tRNA synthetase 2  26.62 
 
 
368 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2297  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  25.32 
 
 
382 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3163  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  27.74 
 
 
382 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902374  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1480  tRNA synthetase class II (G H P and S)  26.3 
 
 
393 aa  93.6  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.34 
 
 
370 aa  93.6  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0923  Histidine--tRNA ligase  28.82 
 
 
370 aa  93.6  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00438339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5103  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.21 
 
 
382 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480937  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.96 
 
 
395 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1740  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.22 
 
 
382 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0902  histidyl-tRNA synthetase 2  26.88 
 
 
395 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.188473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4890  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.64 
 
 
395 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2662  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  26.61 
 
 
394 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1584  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  23.77 
 
 
387 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.495225  unclonable  0.000000222283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4766  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.64 
 
 
395 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 
446 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1713  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.22 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1986  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.11 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0587615  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 
446 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 
446 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>