51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78873 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  100 
 
 
438 aa  900    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  49.75 
 
 
458 aa  384  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  46.15 
 
 
486 aa  338  9e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  42.37 
 
 
431 aa  288  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  34.73 
 
 
831 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  32.81 
 
 
402 aa  212  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  31.48 
 
 
725 aa  195  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  32.11 
 
 
827 aa  193  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  34.51 
 
 
368 aa  192  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  32.41 
 
 
368 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  31.28 
 
 
526 aa  171  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  30.2 
 
 
382 aa  144  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  33.44 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49610  exo-1,3-beta-glucosidase  28.35 
 
 
620 aa  140  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  32.97 
 
 
393 aa  140  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56506  predicted protein  25.2 
 
 
594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286813  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  26.47 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56510  predicted protein  26.38 
 
 
664 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  28.57 
 
 
498 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_1372  predicted protein  30.07 
 
 
523 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192993  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  23.82 
 
 
346 aa  77  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  28.05 
 
 
863 aa  77  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61452  glucan 1,3-beta-glucosidase  22.67 
 
 
506 aa  76.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243086  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  27.98 
 
 
601 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  26.91 
 
 
853 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  28.49 
 
 
573 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  29.02 
 
 
705 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  27.4 
 
 
470 aa  64.7  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 
468 aa  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01332  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  30.18 
 
 
408 aa  63.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  26.64 
 
 
590 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  23.13 
 
 
869 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  22.91 
 
 
847 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.97 
 
 
673 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  24.47 
 
 
489 aa  56.6  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  26.2 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 
357 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  25.75 
 
 
551 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  28.26 
 
 
493 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  28.35 
 
 
331 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  25.12 
 
 
481 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  25 
 
 
481 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  27.59 
 
 
483 aa  47.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  34.85 
 
 
328 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  29.05 
 
 
580 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23.76 
 
 
900 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  34.85 
 
 
329 aa  43.9  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  26.02 
 
 
584 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  21.74 
 
 
1115 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>