267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78175 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  100 
 
 		 584 aa  1209    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.586636 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  50 
 
 		 624 aa  577  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  44 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44978  predicted protein  41.28 
 
 		 532 aa  428  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.800208 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  34.36 
 
 		 591 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47685  predicted protein  30.13 
 
 		 521 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773754 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28602  predicted protein  31.68 
 
 		 517 aa  257  4e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.478127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47021  predicted protein  30.02 
 
 		 509 aa  239  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  27.85 
 
 		 530 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.838735 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10221  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08740)  33.4 
 
 		 631 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.51459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  28.25 
 
 		 479 aa  177  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01423  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04150)  29.82 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.038724 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  25.14 
 
 		 576 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10115  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13970)  25.73 
 
 		 663 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  26.95 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  24.63 
 
 		 508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.587753 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  24.44 
 
 		 1057 aa  108  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03260  hypothetical protein  30.28 
 
 		 308 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.119353  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 439 aa  80.1  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  37.96 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  32.53 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 392 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  33.1 
 
 		 397 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  30.95 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  33.33 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 405 aa  72  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 442 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 391 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03850  expressed protein  24.3 
 
 		 869 aa  68.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  25.32 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  24.89 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 428 aa  67  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 387 aa  67  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  29.03 
 
 		 403 aa  66.6  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  24.89 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  25.45 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  27.27 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  26.95 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  26.95 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.8 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  28.57 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 416 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  28 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 397 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  36.11 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  19.94 
 
 		 388 aa  60.1  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 413 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 436 aa  60.1  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  28 
 
 		 419 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30.08 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  25.15 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  28.26 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  27.84 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  34.33 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  26.03 
 
 		 422 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 400 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>