More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57236 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_57236  methylisocitrate lyase (2-methylisocitrate lyase)  100 
 
 		 299 aa  610  9.999999999999999e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.703646  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03805  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03820)  44.89 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00106331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.28 
 
 		 289 aa  191  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.62 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  39.44 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  37.4 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  39.09 
 
 		 292 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0283  putative methylisocitrate lyase  39.57 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.548186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.2 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  36.3 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  36.36 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  37.83 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  37.83 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  35.53 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  36.89 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  39.69 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  34.34 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  36.76 
 
 		 287 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  36.76 
 
 		 284 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  36.76 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  34.51 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  39.09 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  36.76 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  33.45 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  36.68 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  35.66 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.66 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.66 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  35.31 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  35.66 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  36.86 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  36.96 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  35.66 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.66 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  35.66 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  34.53 
 
 		 274 aa  166  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.66 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.66 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  34.72 
 
 		 288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  35.31 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  35.36 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  33.79 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  35.07 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  35.77 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  35.14 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  33.33 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  40.6 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  34.94 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  33.73 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  35.38 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  36.19 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  34.63 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  35.23 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  34.72 
 
 		 289 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  36.97 
 
 		 287 aa  159  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  36.19 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  34.62 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  37.3 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  33.33 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  36.25 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2421  2-methylisocitrate lyase  34.15 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  37.5 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  36.51 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  35.77 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  35.83 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  34.7 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  34.48 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  33.99 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  34.02 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  34.49 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  33.85 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1587  2-methylisocitrate lyase  36.72 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000235696  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  32.87 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1935  2-methylisocitrate lyase  35.74 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146073  hitchhiker  0.00000021306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  35.74 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  38.36 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  36.12 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0462  2-methylisocitrate lyase  38.36 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237337  hitchhiker  0.00000000745318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  34.98 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  38.36 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  35.74 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1509  2-methylisocitrate lyase  37.5 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265222  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  33.45 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  38.36 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  38.36 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  33.83 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  34.42 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  34.42 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  35.27 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  36.68 
 
 		 304 aa  148  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40267  predicted protein  31.23 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158521  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  35.98 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  36.8 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  35.98 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  35.61 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  33.88 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  38.2 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  38.2 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  33.21 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  34.16 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>