132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_55023 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_55023  urea permease  100 
 
 		 659 aa  1328    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  39.36 
 
 		 699 aa  473  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  38.31 
 
 		 674 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  33.95 
 
 		 724 aa  357  3.9999999999999996e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  33.63 
 
 		 709 aa  356  8.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  34.29 
 
 		 693 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  31.6 
 
 		 704 aa  338  9.999999999999999e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  31.21 
 
 		 643 aa  329  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  31.45 
 
 		 680 aa  319  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  32.12 
 
 		 658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  29.89 
 
 		 668 aa  296  8e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  29.43 
 
 		 692 aa  290  8e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  29.39 
 
 		 668 aa  288  2e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  30.34 
 
 		 679 aa  288  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  24.69 
 
 		 476 aa  103  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  24.63 
 
 		 474 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  26.36 
 
 		 482 aa  97.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  23.39 
 
 		 478 aa  96.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  25.22 
 
 		 488 aa  87.8  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  22.22 
 
 		 500 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  23.44 
 
 		 587 aa  86.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  23.15 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  22.62 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.16 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  20.33 
 
 		 554 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  19.12 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  26.52 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  23.96 
 
 		 638 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  32.09 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  32.09 
 
 		 672 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  25.19 
 
 		 477 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  21.66 
 
 		 492 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.6 
 
 		 522 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  25.13 
 
 		 477 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.6 
 
 		 672 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  25.49 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  35.92 
 
 		 671 aa  52  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  20.79 
 
 		 544 aa  52  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  24.31 
 
 		 483 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 479 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 479 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 479 aa  51.6  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 479 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 479 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  34.58 
 
 		 671 aa  51.6  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  23.51 
 
 		 485 aa  51.2  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  24.87 
 
 		 477 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  21.28 
 
 		 633 aa  51.2  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  33.64 
 
 		 671 aa  50.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  21.05 
 
 		 488 aa  50.8  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 477 aa  50.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  33.64 
 
 		 671 aa  50.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  34.95 
 
 		 671 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  34.95 
 
 		 671 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  34.95 
 
 		 671 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  34.95 
 
 		 671 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  34.95 
 
 		 671 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  34.95 
 
 		 671 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  23.14 
 
 		 592 aa  50.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  21.77 
 
 		 492 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  34.95 
 
 		 807 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  33.64 
 
 		 671 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  33.64 
 
 		 671 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  33.64 
 
 		 671 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  23.76 
 
 		 483 aa  50.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  23.79 
 
 		 489 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  33.64 
 
 		 671 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  21.48 
 
 		 464 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  24.37 
 
 		 477 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  22.67 
 
 		 492 aa  49.7  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  21.77 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  21.77 
 
 		 492 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  21.77 
 
 		 492 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  21.77 
 
 		 492 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  26.2 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  24.11 
 
 		 483 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  21.77 
 
 		 492 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  21.77 
 
 		 492 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  23.08 
 
 		 562 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  23.91 
 
 		 483 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  22 
 
 		 502 aa  48.9  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  23.92 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  23.03 
 
 		 489 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  21.43 
 
 		 462 aa  48.5  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.49 
 
 		 489 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  23.56 
 
 		 543 aa  47.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  20.27 
 
 		 487 aa  47.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.71 
 
 		 565 aa  47.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  23.58 
 
 		 587 aa  47.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.38 
 
 		 482 aa  47.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  23.53 
 
 		 506 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  22.2 
 
 		 492 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  23.78 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  25.16 
 
 		 729 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.02 
 
 		 522 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  23.15 
 
 		 488 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  22.12 
 
 		 483 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  23.39 
 
 		 495 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  26.21 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  23.02 
 
 		 539 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>