More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42440 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_42440  DL-glycerol-3-phosphatase  100 
 
 		 253 aa  523  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal  0.151042 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01216  Glycerol-3-phosphate phosphatasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC6]  37.73 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00109898  normal  0.137881 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  33.04 
 
 		 250 aa  125  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02470  phosphatase, putative  31.1 
 
 		 411 aa  122  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4784  HAD family hydrolase  38.76 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.625758  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.78 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  37.86 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  32.88 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  32.31 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  32.09 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  34.55 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  36.08 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.23 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  31.31 
 
 		 218 aa  99.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.23 
 
 		 222 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  30.41 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  33.33 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.46 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  30.7 
 
 		 218 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  30.7 
 
 		 218 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  31.63 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  32.64 
 
 		 224 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0649  HAD family hydrolase  32.95 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  31.94 
 
 		 219 aa  92.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  30.56 
 
 		 216 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.69 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  30.56 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  30.56 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  29.11 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  29.63 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  29.63 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01280  glycerol-1-phosphatase, putative  34.09 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  29.63 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.02 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  29.63 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.69 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  29.58 
 
 		 219 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  29.58 
 
 		 219 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  29.58 
 
 		 219 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.52 
 
 		 220 aa  85.9  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  29.58 
 
 		 219 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  29.58 
 
 		 219 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32600  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.95 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.19 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.56 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.87 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  28.82 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  25.4 
 
 		 735 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3383  HAD family hydrolase  31.64 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  27.06 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.68 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  29.11 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  25.68 
 
 		 456 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  30 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  25.99 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  26.7 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03180  hypothetical protein  27.41 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  26.27 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  24.55 
 
 		 456 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.6 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  29.52 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  40.26 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  24.42 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4274  6-phosphogluconate phosphatase  26.9 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.35 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  30.87 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  25.2 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.54 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.66 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  30.24 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.02 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  27.46 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  38.67 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.65 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.79741  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15581  phosphatase/phosphohexomutase  27.1 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  30 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  25.94 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  26.78 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  29.07 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  27.16 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20940  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.02 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  27.35 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.4 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  29.91 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.26 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.66 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>