245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42893 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42893  predicted protein  100 
 
 		 766 aa  1590    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  38.52 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  36.3 
 
 		 403 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  37.04 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  35.56 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  36.89 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  34.43 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  34.07 
 
 		 400 aa  63.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  33.33 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  36.29 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  27.92 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.81 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  33.9 
 
 		 395 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  30.15 
 
 		 425 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  32.82 
 
 		 407 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0610  cysteine desulfurase SufS  32.19 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.65 
 
 		 406 aa  60.1  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  30.82 
 
 		 665 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2402  cysteine desulfurase SufS  32.19 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2887  cysteine desulfurase SufS  32.19 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2706  cysteine desulfurase SufS  32.19 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.994563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2763  cysteine desulfurase SufS  32.19 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1715  cysteine desulfurase SufS  32.19 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.023757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.71 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  34.06 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.89 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  33.33 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2826  cysteine desulfurase SufS  31.51 
 
 		 413 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35218  predicted protein  25 
 
 		 470 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0218366  normal  0.484012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.06 
 
 		 610 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.09 
 
 		 560 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  29.37 
 
 		 411 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.82 
 
 		 414 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 		 406 aa  55.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.71 
 
 		 414 aa  55.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  32.71 
 
 		 410 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  34.33 
 
 		 398 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  30 
 
 		 406 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  30 
 
 		 406 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  30 
 
 		 406 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  30 
 
 		 406 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  30 
 
 		 406 aa  55.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  30 
 
 		 406 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  30 
 
 		 406 aa  55.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  30 
 
 		 406 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.63 
 
 		 605 aa  55.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  30 
 
 		 406 aa  54.7  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  30 
 
 		 406 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  30.99 
 
 		 420 aa  54.7  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  29.8 
 
 		 411 aa  54.7  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.22 
 
 		 604 aa  54.7  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.22 
 
 		 604 aa  54.7  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.53 
 
 		 419 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  28.78 
 
 		 682 aa  54.3  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  30 
 
 		 406 aa  54.3  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  28.57 
 
 		 419 aa  54.3  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1139  Cysteine desulfurase  25.74 
 
 		 400 aa  54.3  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  26.62 
 
 		 412 aa  54.3  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.87 
 
 		 415 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  34.55 
 
 		 457 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  29.5 
 
 		 685 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1794  cysteine desulfurase SufS  31.51 
 
 		 412 aa  53.9  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.885674  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  29.73 
 
 		 425 aa  53.5  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  29.73 
 
 		 421 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  33.08 
 
 		 401 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 414 aa  53.9  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.29 
 
 		 406 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  35.59 
 
 		 404 aa  53.9  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  27.14 
 
 		 414 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 414 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  34.81 
 
 		 397 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  28.78 
 
 		 660 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  28.78 
 
 		 660 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  29.5 
 
 		 660 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  28.78 
 
 		 660 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  28.78 
 
 		 671 aa  52.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  30.6 
 
 		 399 aa  52.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.88 
 
 		 414 aa  52.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.71 
 
 		 413 aa  52.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  32.2 
 
 		 409 aa  52.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  28.78 
 
 		 660 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  31.88 
 
 		 420 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  30.07 
 
 		 406 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  29.5 
 
 		 626 aa  52  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  30.07 
 
 		 406 aa  52  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  29.66 
 
 		 387 aa  52  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.07 
 
 		 406 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  30.43 
 
 		 423 aa  52  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.54 
 
 		 406 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.68 
 
 		 418 aa  52  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.14 
 
 		 415 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30 
 
 		 420 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.68 
 
 		 418 aa  52  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42815  predicted protein  26.97 
 
 		 474 aa  51.6  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.952072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 413 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.86 
 
 		 413 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.32 
 
 		 414 aa  51.2  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.44 
 
 		 428 aa  51.2  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.08 
 
 		 408 aa  51.2  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>