71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1119 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  100 
 
 		 186 aa  381  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  49.33 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  48.63 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  46.15 
 
 		 160 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  44.52 
 
 		 230 aa  160  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  43.95 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  40.37 
 
 		 196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  38.37 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  42.95 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  35.29 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  41.52 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  36.94 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  39.38 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  38.82 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  39.24 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  35.29 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  44.53 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  41.78 
 
 		 180 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  45.59 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  35.59 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  43.45 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  40.69 
 
 		 228 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  39.02 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  36.13 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  41.22 
 
 		 169 aa  117  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  35.9 
 
 		 157 aa  114  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  33.17 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.3 
 
 		 428 aa  105  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  28.57 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  28.42 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  35 
 
 		 159 aa  92  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  29.86 
 
 		 489 aa  90.1  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  30.97 
 
 		 159 aa  88.2  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  32.17 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  26.44 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  31.37 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  33.81 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  35.4 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  31.29 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  31.51 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  28.68 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  34.65 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  35.14 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  24.19 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  28.57 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  28.24 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  31.45 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  32.8 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  25.38 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  26.12 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 297 aa  51.6  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  24.39 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  30.85 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  25.6 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  29.73 
 
 		 161 aa  48.9  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  27.61 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  25.93 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.35 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  27.54 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0173  putative dialkylrecorsinol condensing enzyme  27.05 
 
 		 309 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  23.26 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  28.68 
 
 		 303 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  25.35 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.4 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.15 
 
 		 281 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  25.98 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  28.71 
 
 		 199 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>