More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1414 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 443 aa  920    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  77.24 
 
 		 446 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 443 aa  920    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  66.06 
 
 		 451 aa  595  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  65.75 
 
 		 446 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  49.31 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  48.06 
 
 		 449 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  45.31 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  47.07 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  49.32 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.63 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  47.38 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  47.07 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  48.17 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  45.39 
 
 		 468 aa  365  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  39.72 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  42.36 
 
 		 468 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  44.44 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  38.78 
 
 		 469 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.63 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.5 
 
 		 459 aa  308  8e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.96 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  38.71 
 
 		 452 aa  274  3e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  38.66 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.23 
 
 		 450 aa  269  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.23 
 
 		 450 aa  265  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  38.04 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.93 
 
 		 452 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.16 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.73 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.14 
 
 		 451 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.97 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  25.72 
 
 		 411 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.33 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1024 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1024 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  33.07 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.83 
 
 		 989 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  36.61 
 
 		 1000 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.64 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1015 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  28.99 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.65 
 
 		 466 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.49 
 
 		 490 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.45 
 
 		 496 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  26.61 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  31.84 
 
 		 503 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.12 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  30.65 
 
 		 500 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  26.38 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3638  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  30.18 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147047  normal  0.472178 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.52 
 
 		 485 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  29.84 
 
 		 497 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.13 
 
 		 485 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.8 
 
 		 497 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.84 
 
 		 499 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.84 
 
 		 497 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.8 
 
 		 497 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  25.24 
 
 		 497 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.81 
 
 		 472 aa  87.4  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  25.76 
 
 		 492 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  31.96 
 
 		 499 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  34.63 
 
 		 461 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.7 
 
 		 890 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  31.13 
 
 		 470 aa  86.7  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.35 
 
 		 497 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3260  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.6 
 
 		 512 aa  86.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.1 
 
 		 499 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  25.35 
 
 		 497 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.35 
 
 		 497 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.15 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  31.96 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.16 
 
 		 511 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0222  FAD linked oxidase domain protein  34.02 
 
 		 502 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  30.92 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  30.89 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.13 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.23 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.43 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  25.41 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.09 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.78 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.1 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  31.73 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  29.47 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  30.95 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.62 
 
 		 887 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0417  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.589159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.23 
 
 		 497 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  31.09 
 
 		 499 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.69 
 
 		 469 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  25.75 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.77 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  28.87 
 
 		 1015 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  28.23 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  31.09 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  28.73 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.08 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>