70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5594 on replicon NC_011732
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  100 
 
 		 329 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  38.8 
 
 		 336 aa  196  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  40.07 
 
 		 371 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  40.07 
 
 		 371 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  40.07 
 
 		 371 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  41.29 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  35.67 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  35.93 
 
 		 344 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  37.59 
 
 		 358 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  37.83 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  34.78 
 
 		 354 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  33.33 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  33.45 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  30.99 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  30.23 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  31.18 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  33.07 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  30.61 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  31.45 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  33.02 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  32.16 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  29.17 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  30 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  33.63 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  31.33 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  31.37 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  28.33 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  27.08 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  26.91 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  29.02 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  29.02 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  27.27 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  29.02 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  28.62 
 
 		 554 aa  90.1  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1002 aa  88.2  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  26.05 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  30.11 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  31.63 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  25.73 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  24.78 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  25.73 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  25.73 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  25.36 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  25.15 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  31.21 
 
 		 686 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  25.15 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  32.14 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  28.63 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  24.48 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  29.68 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  32.58 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  28.63 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  28.97 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  43.33 
 
 		 2272 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  28.08 
 
 		 1678 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  26.59 
 
 		 714 aa  62.8  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  27.63 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  22.89 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  25.66 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  28.04 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  21.8 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  25.26 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  29.76 
 
 		 470 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  38.46 
 
 		 1113 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  29.03 
 
 		 615 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  24.74 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  40.32 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  27.62 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  25.8 
 
 		 753 aa  43.5  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  25 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>