More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4236 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4236  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  57.26 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  56.96 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  53.22 
 
 		 237 aa  241  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2507  winged helix family two component transcriptional regulator  52.79 
 
 		 233 aa  239  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1917  two component transcriptional regulator  53.02 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.332821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2390  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.64 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2339  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.64 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3430  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  39.47 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  37.97 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  39.47 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 235 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.38 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  39.04 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  39.15 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  39.15 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  38.72 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 233 aa  168  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  38.72 
 
 		 242 aa  169  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.72 
 
 		 243 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.72 
 
 		 243 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  39.04 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.3 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  36.48 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  38.49 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  41.2 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  41 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.25 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  38.08 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  36.48 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2564  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 221 aa  165  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  38.3 
 
 		 244 aa  164  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  36.07 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 406 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 227 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  37.08 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  38.63 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  39.06 
 
 		 297 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.34 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.69 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  40.08 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>