128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32750 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32750  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  766    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196352  hitchhiker  0.0000232684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  98.69 
 
 		 382 aa  759    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  68.67 
 
 		 392 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.2 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  37.32 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  39.69 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.63 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  37.88 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.62 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  38.78 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  39.59 
 
 		 408 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  38.29 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  39.12 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  38.39 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.13 
 
 		 412 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.45 
 
 		 409 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.98 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3317  PepSY-associated TM helix domain protein  39.3 
 
 		 446 aa  242  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00586385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2382  PepSY-associated TM helix  34.9 
 
 		 428 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.964791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0337  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.44 
 
 		 412 aa  228  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1511  hypothetical protein  29.51 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1822  hypothetical protein  32.91 
 
 		 427 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1911  hypothetical protein  27.99 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.134613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  28.57 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  27.02 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.19 
 
 		 369 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  26.63 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.38 
 
 		 425 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.52 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  26.32 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  25.27 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.13 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.96 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  23.57 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  25.26 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.13 
 
 		 840 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  26.91 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.25 
 
 		 850 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  26.96 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  25.07 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  23.89 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.56 
 
 		 850 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.56 
 
 		 849 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  24.8 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 1117 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.05 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  24.55 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.74 
 
 		 851 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  24.08 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.18 
 
 		 842 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  22.39 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  22.86 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.15 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  24.44 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  27.75 
 
 		 850 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  24.36 
 
 		 844 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  21.74 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  21 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.57 
 
 		 843 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  21.5 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  29.2 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.85 
 
 		 850 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.38 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  22.67 
 
 		 783 aa  59.7  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.97 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.62 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  23.37 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  21.59 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  23.43 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  25 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  22.35 
 
 		 822 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  21.12 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  23.91 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  26.42 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  21.88 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.97 
 
 		 575 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  23.21 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  24.61 
 
 		 397 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.83 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  24.09 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.06 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  22.61 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  21.46 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  20.63 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  22.61 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  23.44 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  24.01 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  22.73 
 
 		 471 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.54 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  22.89 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  20.98 
 
 		 469 aa  50.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  25.76 
 
 		 451 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  21.82 
 
 		 471 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.77 
 
 		 885 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  21.68 
 
 		 540 aa  50.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20 
 
 		 482 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 525 aa  49.7  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.55 
 
 		 840 aa  49.7  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.45 
 
 		 374 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>