More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.94 
 
 		 480 aa  706    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  74.21 
 
 		 512 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  71.88 
 
 		 480 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  72.73 
 
 		 480 aa  700    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  71.67 
 
 		 481 aa  658    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  74.84 
 
 		 480 aa  730    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  69.6 
 
 		 480 aa  664    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  93.29 
 
 		 477 aa  882    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  74.84 
 
 		 480 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.94 
 
 		 480 aa  700    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  978    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.6 
 
 		 483 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  60.08 
 
 		 477 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  60.08 
 
 		 477 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  60.08 
 
 		 477 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  60.08 
 
 		 477 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  60.08 
 
 		 477 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  60.08 
 
 		 477 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  59.87 
 
 		 477 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  57.51 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.55 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  53.73 
 
 		 489 aa  461  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.08 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.49 
 
 		 479 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.49 
 
 		 479 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.62 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.79 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  43.71 
 
 		 488 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  51.87 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.46 
 
 		 477 aa  273  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.94 
 
 		 488 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.22 
 
 		 478 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.18 
 
 		 479 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.38 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.43 
 
 		 484 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.42 
 
 		 495 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  31.98 
 
 		 499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.4 
 
 		 504 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.67 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.97 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.18 
 
 		 507 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.85 
 
 		 503 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.23 
 
 		 504 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.78 
 
 		 517 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.82 
 
 		 529 aa  170  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.44 
 
 		 514 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.14 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  29.83 
 
 		 505 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.15 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.81 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.15 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.66 
 
 		 505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.56 
 
 		 552 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.35 
 
 		 523 aa  163  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  34.63 
 
 		 542 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  31.87 
 
 		 513 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 		 454 aa  160  6e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.63 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.58 
 
 		 547 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.98 
 
 		 528 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.77 
 
 		 544 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.41 
 
 		 522 aa  153  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.58 
 
 		 546 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.18 
 
 		 481 aa  143  7e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.48 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.03 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.75 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.07 
 
 		 473 aa  134  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.79 
 
 		 457 aa  133  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.68 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.81 
 
 		 475 aa  124  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.99 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  27.13 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.36 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.28 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  26.5 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.67 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  26.9 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  24.58 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  25.28 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.02 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.36 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.94 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.19 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.22 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.15 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.05 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.29 
 
 		 491 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.25 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  25 
 
 		 467 aa  97.8  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.39 
 
 		 458 aa  96.7  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.02 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  28.92 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.15 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.84 
 
 		 454 aa  95.1  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.5 
 
 		 437 aa  93.2  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  28.12 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  29.1 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.84 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>