More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17641 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  100 
 
 		 217 aa  457  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  68.87 
 
 		 217 aa  317  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  67.74 
 
 		 217 aa  313  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  65.9 
 
 		 217 aa  311  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  65.9 
 
 		 217 aa  310  9e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  66.03 
 
 		 217 aa  300  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  66.5 
 
 		 217 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  65.53 
 
 		 217 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  65.05 
 
 		 217 aa  285  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  60.83 
 
 		 217 aa  277  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  59.43 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  58.06 
 
 		 227 aa  269  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  59.81 
 
 		 220 aa  258  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  54.81 
 
 		 237 aa  234  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.73 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  57.22 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.81 
 
 		 218 aa  231  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  54.9 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.73 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  42.03 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  42.35 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  42.65 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  40.09 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  40.58 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  42.93 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  43.43 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  44.61 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  44.55 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  40.1 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  40.1 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  43.94 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  43.94 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  39.81 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  44.12 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  41 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  43 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  44.61 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  39.39 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0069  endonuclease III  42.93 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  44.06 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  43.43 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  39.39 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  42.29 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  40.98 
 
 		 224 aa  156  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  40.2 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  38.07 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  43.56 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  43.63 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.63 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  43.72 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  43.35 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  44.12 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  43.56 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.08 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  40.89 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  39.69 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  39.69 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  39.69 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  39.69 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  39.69 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  41 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  39.22 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  39.69 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  43.63 
 
 		 335 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  42.49 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  39.69 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  42.49 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1074  endonuclease III  42.16 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  43.65 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.46 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  42.65 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  41.18 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  42.16 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  40.2 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  41.18 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  39.71 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  44.83 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  42.65 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  39.69 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0857  endonuclease III  42.05 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  43.01 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  43.52 
 
 		 254 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  43.07 
 
 		 249 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  40.29 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  43.56 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  40.5 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.08 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  40.7 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  40.7 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  42.16 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  42.31 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  42.05 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  39.8 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  40.69 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  43.56 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  42.57 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  42.18 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  42.18 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  43.22 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>