More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16981 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_16981  ABC transporter,membrane component, glycine betaine/proline family protein  100 
 
 
304 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0739  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  60.94 
 
 
301 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.483672  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0691  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  60.94 
 
 
299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.3 
 
 
301 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 
294 aa  289  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02042  transmembrane ABC transporter protein  51.04 
 
 
298 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.91 
 
 
294 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.19 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000001583  hitchhiker  0.0000000544844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5091  choline ABC transporter, permease protein  51.4 
 
 
298 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 
298 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.669781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4810  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.09 
 
 
298 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5108  choline ABC transporter, permease protein  51.82 
 
 
298 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0967  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  51.82 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.82 
 
 
298 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.82 
 
 
298 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00870989  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.18 
 
 
290 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0808444  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3449  choline ABC transporter, permease protein  52.24 
 
 
301 aa  278  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.22 
 
 
295 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0456  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  51.09 
 
 
298 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.424903  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3486  choline ABC transporter, permease protein  53.21 
 
 
298 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.180465 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2026  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  50.88 
 
 
300 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1932  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  50.88 
 
 
300 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0565  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  50.88 
 
 
300 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.120464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1869  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  50.88 
 
 
300 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0449  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  50.88 
 
 
300 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0902  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  50.88 
 
 
300 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.85 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.65 
 
 
281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1615  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  52.61 
 
 
300 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5041  choline ABC transporter, permease protein  52.24 
 
 
300 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503755 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1061  hypothetical protein  53.43 
 
 
280 aa  263  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.01 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.679353  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.08 
 
 
376 aa  259  6e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.197638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.3 
 
 
277 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3477  glycine betaine transporter membrane protein  51.82 
 
 
400 aa  252  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3734  glycine betaine transporter membrane protein  51.82 
 
 
374 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0864  glycine betaine transporter membrane protein  50.71 
 
 
400 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003610  L-proline Glycine Betaine ABC transport system permease protein proW  50.18 
 
 
363 aa  248  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.55 
 
 
278 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0667053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0896  glycine betaine transporter membrane protein  49.82 
 
 
392 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.652731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3158  glycine betaine transporter membrane protein  50.36 
 
 
355 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.363018  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0502  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  50.56 
 
 
276 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.819479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3321  glycine betaine transporter membrane protein  50.73 
 
 
422 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0615  glycine betaine ABC transporter, binding protein inner membrane component  49.28 
 
 
356 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00230108  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2377  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  50.75 
 
 
274 aa  245  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.336492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1902  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.91 
 
 
276 aa  245  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00849188  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1114  glycine betaine transporter membrane protein  51.09 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1060  glycine betaine transporter membrane protein  51.09 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3535  glycine betaine transporter membrane protein  51.09 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.872834  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2476  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.28 
 
 
357 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.43 
 
 
289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
399 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00496589  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.75 
 
 
400 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0842907  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.75 
 
 
400 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47 
 
 
317 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.565238  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.27 
 
 
279 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0079247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3116  glycine betaine transporter membrane protein  51.09 
 
 
354 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.334495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2993  glycine betaine transporter membrane protein  50.72 
 
 
354 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  0.0117582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2800  glycine betaine transporter membrane protein  50.18 
 
 
354 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2927  glycine betaine transporter membrane protein  50.72 
 
 
354 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02534  glycine betaine transporter subunit  49.64 
 
 
354 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.64 
 
 
354 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3010  glycine betaine transporter membrane protein  50.72 
 
 
354 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3922  glycine betaine transporter membrane protein  49.64 
 
 
354 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2958  glycine betaine transporter membrane protein  50.72 
 
 
354 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0341779 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1028  glycine betaine transporter membrane protein  49.64 
 
 
354 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.230597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02498  hypothetical protein  49.64 
 
 
354 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3201  glycine betaine transporter membrane protein  49.64 
 
 
354 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2814  glycine betaine transporter membrane protein  49.64 
 
 
354 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2959  glycine betaine transporter membrane protein  49.64 
 
 
354 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.36 
 
 
283 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 
282 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.81 
 
 
283 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0381143  normal  0.921004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3059  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  46.95 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.98 
 
 
287 aa  231  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659983  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0674  glycine/betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  48.54 
 
 
279 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000586111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.71 
 
 
283 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000687252  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
281 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.542152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2929  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter permease  53.44 
 
 
415 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1376  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  47.74 
 
 
652 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369923 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.41 
 
 
278 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.73 
 
 
278 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0116658  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.65 
 
 
283 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.2 
 
 
279 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01120  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  44.96 
 
 
298 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
277 aa  228  7e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.316827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26210  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  47.58 
 
 
310 aa  228  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
277 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281492  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1541  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  46.85 
 
 
573 aa  228  9e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.11623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0295  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  44.24 
 
 
281 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.698088  hitchhiker  0.0000339096 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.49 
 
 
316 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0670806  normal  0.08515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.24 
 
 
281 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247617  normal  0.0422792 
 
 
-
 
NC_004310  BR1580  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  45.52 
 
 
278 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
277 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1525  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  45.52 
 
 
278 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 
277 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.85 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.712139 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06177  glycine betaine/L-proline ABC transporter permease protein  45.62 
 
 
280 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.86 
 
 
451 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0787924  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0320  choline ABC transporter, permease protein  44.24 
 
 
281 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>