More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1541 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1796  amino acid ABC transporter, permease protein  58.58 
 
 
575 aa  679    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.135141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1541  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  100 
 
 
573 aa  1150    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.11623  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0358  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  64.96 
 
 
571 aa  728    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.963399  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0691  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  52.69 
 
 
299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0739  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  52.69 
 
 
301 aa  274  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.483672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.44 
 
 
294 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.7 
 
 
278 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0667053  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1061  hypothetical protein  52.79 
 
 
280 aa  271  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2377  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  52.96 
 
 
274 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.336492 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.94 
 
 
282 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5091  choline ABC transporter, permease protein  51.1 
 
 
298 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.1 
 
 
298 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.669781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4810  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.1 
 
 
298 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.06 
 
 
301 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02042  transmembrane ABC transporter protein  50 
 
 
298 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5108  choline ABC transporter, permease protein  50.74 
 
 
298 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 
298 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 
298 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00870989  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1932  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  51.1 
 
 
300 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1869  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  51.1 
 
 
300 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0565  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  51.1 
 
 
300 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.120464  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2026  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  51.1 
 
 
300 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0449  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  51.1 
 
 
300 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0902  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  51.1 
 
 
300 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0967  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  50.74 
 
 
300 aa  261  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3486  choline ABC transporter, permease protein  51.1 
 
 
298 aa  261  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.180465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0456  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  50.37 
 
 
298 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.424903  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
290 aa  260  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0808444  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
278 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000001583  hitchhiker  0.0000000544844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0864  glycine betaine transporter membrane protein  51.49 
 
 
400 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.96 
 
 
281 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3449  choline ABC transporter, permease protein  49.26 
 
 
301 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.45 
 
 
279 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423644  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.29 
 
 
289 aa  250  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01120  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  48.89 
 
 
298 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.94 
 
 
278 aa  248  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0116658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.31 
 
 
279 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0079247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2476  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.71 
 
 
357 aa  248  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0502  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  47.81 
 
 
276 aa  247  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.819479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1901  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  46.62 
 
 
294 aa  247  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135733  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5041  choline ABC transporter, permease protein  50.37 
 
 
300 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3477  glycine betaine transporter membrane protein  49.44 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1615  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
300 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0896  glycine betaine transporter membrane protein  48.89 
 
 
392 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.652731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.48 
 
 
279 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3321  glycine betaine transporter membrane protein  48.7 
 
 
422 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.26 
 
 
294 aa  244  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3406  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  45.98 
 
 
278 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.4 
 
 
283 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000687252  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1902  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
276 aa  243  7.999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00849188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0734  response regulator receiver protein  41.94 
 
 
282 aa  243  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.909833  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1062  hypothetical protein  42.86 
 
 
298 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003610  L-proline Glycine Betaine ABC transport system permease protein proW  46.81 
 
 
363 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4110  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.59 
 
 
662 aa  242  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3535  glycine betaine transporter membrane protein  50 
 
 
388 aa  241  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.872834  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1060  glycine betaine transporter membrane protein  50 
 
 
388 aa  240  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1114  glycine betaine transporter membrane protein  50 
 
 
388 aa  240  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 
295 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.39 
 
 
317 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.565238  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3059  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  47.58 
 
 
321 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67280  ABC transporter permease  45.42 
 
 
283 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5829  ABC transporter permease  45.42 
 
 
283 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3158  glycine betaine transporter membrane protein  46.5 
 
 
355 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.363018  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2378  glycine betaine/L-proline ABC transporter, solute-binding protein  43.12 
 
 
312 aa  237  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.64 
 
 
283 aa  237  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0381143  normal  0.921004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 
278 aa  236  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.1 
 
 
283 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3734  glycine betaine transporter membrane protein  47.58 
 
 
374 aa  236  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4028  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  42.86 
 
 
278 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.662148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.88 
 
 
283 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.158267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2815  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 
278 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2548  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  49.45 
 
 
278 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000537684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3733  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  42.5 
 
 
278 aa  234  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.409518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02534  glycine betaine transporter subunit  47.39 
 
 
354 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.39 
 
 
354 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2596  glycine betaine/L-proline ABC transporter permease  48.73 
 
 
278 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2515  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  48.73 
 
 
278 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0992  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  40 
 
 
289 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0300335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0363  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.45 
 
 
283 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3201  glycine betaine transporter membrane protein  47.39 
 
 
354 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02498  hypothetical protein  47.39 
 
 
354 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2785  glycine betaine/L-proline ABC transporter permease protein  48.73 
 
 
278 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.79114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2795  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  48.73 
 
 
278 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1028  glycine betaine transporter membrane protein  47.39 
 
 
354 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.230597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2959  glycine betaine transporter membrane protein  47.39 
 
 
354 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2800  glycine betaine transporter membrane protein  47.39 
 
 
354 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3116  glycine betaine transporter membrane protein  48.08 
 
 
354 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.334495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2792  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  48.73 
 
 
278 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0105765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3922  glycine betaine transporter membrane protein  47.39 
 
 
354 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.74 
 
 
278 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2814  glycine betaine transporter membrane protein  47.39 
 
 
354 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2837  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  48.73 
 
 
278 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.148231  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2927  glycine betaine transporter membrane protein  47.74 
 
 
354 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2993  glycine betaine transporter membrane protein  47.74 
 
 
354 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  0.0117582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2497  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 
278 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0773919  normal  0.709864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
272 aa  233  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24580  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  45.26 
 
 
303 aa  233  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193054  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.45 
 
 
280 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
451 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0787924  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3010  glycine betaine transporter membrane protein  47.39 
 
 
354 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>