More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_07971 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 370 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  61.41 
 
 		 368 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  60.87 
 
 		 368 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  58.97 
 
 		 372 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  58.95 
 
 		 377 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  58.33 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  56.03 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  55.75 
 
 		 363 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  55.17 
 
 		 363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  53.99 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  52.73 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  53.15 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  53.13 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  53.13 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  52.91 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  51.66 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  49.31 
 
 		 364 aa  362  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  47.37 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  47.47 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  46.63 
 
 		 359 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  46.61 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  50.61 
 
 		 374 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  45.89 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 360 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  44.87 
 
 		 362 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  49.19 
 
 		 366 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  45.15 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  44.88 
 
 		 366 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  45.62 
 
 		 361 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 358 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  44.28 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  45 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  41.53 
 
 		 363 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  45.06 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  46.63 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  46.77 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.7 
 
 		 370 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  43.44 
 
 		 362 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 359 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  43.99 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  44.01 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  43.84 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 358 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  45.26 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  44.22 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  45.86 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  44.85 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  44.61 
 
 		 368 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 388 aa  279  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  43.97 
 
 		 363 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  47.15 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  43.19 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  45.22 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  45.22 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  45.35 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  45.99 
 
 		 364 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  44.93 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  45.99 
 
 		 364 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  43.97 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  43.21 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  47.22 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  43.35 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  43.55 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  43.8 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  44.38 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  43.64 
 
 		 368 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 360 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  45.65 
 
 		 365 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  45.96 
 
 		 365 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  43.93 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  42.74 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  46.18 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0016  3-dehydroquinate synthase  45.77 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  44.73 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  43.52 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  46.47 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  43.1 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  43.39 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  40.11 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  45.34 
 
 		 376 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  41.87 
 
 		 368 aa  273  5.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  43.93 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  45.34 
 
 		 365 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 368 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  42.53 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>