264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4085 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
763 aa  1554    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  27.05 
 
 
837 aa  259  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.32 
 
 
835 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  28.59 
 
 
813 aa  249  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 
786 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 
785 aa  229  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.77 
 
 
813 aa  209  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  27.25 
 
 
861 aa  206  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.06 
 
 
818 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  27.89 
 
 
891 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  29.73 
 
 
840 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  28.24 
 
 
860 aa  201  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  30.32 
 
 
812 aa  200  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  29.9 
 
 
831 aa  200  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 
891 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.69 
 
 
845 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.9 
 
 
817 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  26.7 
 
 
864 aa  194  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.85 
 
 
842 aa  194  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.01 
 
 
845 aa  193  9e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  28.4 
 
 
819 aa  188  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  30.41 
 
 
829 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.73 
 
 
872 aa  183  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  28.85 
 
 
846 aa  181  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  28.17 
 
 
824 aa  180  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  24.82 
 
 
793 aa  179  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  30.05 
 
 
799 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.57 
 
 
843 aa  178  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  25.67 
 
 
863 aa  177  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  27.95 
 
 
839 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  26.9 
 
 
875 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 
871 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  30.43 
 
 
880 aa  172  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  29.32 
 
 
833 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  25.71 
 
 
823 aa  168  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  24.3 
 
 
837 aa  164  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  25.56 
 
 
819 aa  160  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 
897 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  24.77 
 
 
838 aa  151  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  24.95 
 
 
819 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  23.14 
 
 
802 aa  150  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  27.23 
 
 
802 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  25.51 
 
 
815 aa  145  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  25.2 
 
 
824 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.03 
 
 
843 aa  143  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  27.77 
 
 
940 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 
734 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.22 
 
 
744 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.71 
 
 
971 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 
1144 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  23.71 
 
 
847 aa  128  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 
906 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  26.13 
 
 
821 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.84 
 
 
984 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  26.41 
 
 
845 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 
663 aa  126  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  26.68 
 
 
962 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.12 
 
 
878 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  25.49 
 
 
882 aa  124  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 
816 aa  120  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 
724 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
739 aa  114  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  25.54 
 
 
882 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  27.72 
 
 
839 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  28 
 
 
839 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  28 
 
 
839 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  28 
 
 
839 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  27.81 
 
 
839 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.21 
 
 
720 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  27.81 
 
 
839 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  27.81 
 
 
839 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  27.81 
 
 
839 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  24.81 
 
 
827 aa  101  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.25 
 
 
1362 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  25.24 
 
 
820 aa  99  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  24.5 
 
 
816 aa  97.8  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  25.49 
 
 
812 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  25.73 
 
 
811 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  24.16 
 
 
828 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  24.16 
 
 
828 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  24.16 
 
 
828 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.59 
 
 
826 aa  92  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.06 
 
 
826 aa  92.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.24 
 
 
614 aa  87.4  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  23.68 
 
 
825 aa  87.4  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  25.15 
 
 
856 aa  87  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.83 
 
 
623 aa  84.7  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 
853 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26 
 
 
1033 aa  81.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.18 
 
 
905 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 
627 aa  79  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 
645 aa  77  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.6 
 
 
614 aa  76.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.49 
 
 
1005 aa  75.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  23.61 
 
 
1046 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 
623 aa  75.5  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.68 
 
 
621 aa  73.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.62 
 
 
1041 aa  73.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  25.98 
 
 
625 aa  71.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.28 
 
 
884 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>