More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3877 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 		 656 aa  1318    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  43.75 
 
 		 611 aa  531  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  45.08 
 
 		 609 aa  495  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  41.7 
 
 		 608 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.93 
 
 		 605 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.73 
 
 		 598 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.73 
 
 		 598 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.29 
 
 		 590 aa  365  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.27 
 
 		 587 aa  347  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.56 
 
 		 589 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  35.74 
 
 		 583 aa  323  6e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.31 
 
 		 637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  33.8 
 
 		 616 aa  290  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.06 
 
 		 590 aa  290  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.18 
 
 		 614 aa  287  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.04 
 
 		 615 aa  286  9e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  32.93 
 
 		 612 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.23 
 
 		 621 aa  283  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.7 
 
 		 613 aa  281  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.88 
 
 		 613 aa  279  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  32.66 
 
 		 616 aa  276  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  34.06 
 
 		 513 aa  276  7e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  32.14 
 
 		 617 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.09 
 
 		 617 aa  267  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  34.57 
 
 		 623 aa  267  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.27 
 
 		 616 aa  266  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.38 
 
 		 604 aa  265  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.59 
 
 		 613 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  31.97 
 
 		 616 aa  263  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.09 
 
 		 620 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.25 
 
 		 629 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.64 
 
 		 640 aa  257  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  30.9 
 
 		 618 aa  257  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.02 
 
 		 649 aa  250  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.92 
 
 		 593 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.92 
 
 		 593 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.92 
 
 		 613 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.92 
 
 		 593 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  32.05 
 
 		 621 aa  243  7.999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.06 
 
 		 595 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  31.52 
 
 		 618 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  31.52 
 
 		 622 aa  238  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  31.52 
 
 		 618 aa  238  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  31.52 
 
 		 618 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.52 
 
 		 618 aa  237  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  31.52 
 
 		 618 aa  238  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  31.52 
 
 		 618 aa  238  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  29.75 
 
 		 616 aa  237  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  30.12 
 
 		 616 aa  237  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.06 
 
 		 626 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.61 
 
 		 595 aa  236  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.61 
 
 		 566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  30.12 
 
 		 616 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  31.38 
 
 		 618 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.33 
 
 		 594 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  31.18 
 
 		 618 aa  232  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  32.08 
 
 		 601 aa  231  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.63 
 
 		 596 aa  228  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.03 
 
 		 661 aa  227  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.57 
 
 		 611 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  30.23 
 
 		 569 aa  220  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.02 
 
 		 875 aa  220  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.13 
 
 		 597 aa  219  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.35 
 
 		 563 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.97 
 
 		 605 aa  217  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.97 
 
 		 605 aa  217  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.09 
 
 		 625 aa  216  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.91 
 
 		 570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  30.9 
 
 		 601 aa  213  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.33 
 
 		 615 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.09 
 
 		 614 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.97 
 
 		 615 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.97 
 
 		 615 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  49.14 
 
 		 633 aa  207  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.23 
 
 		 614 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.23 
 
 		 614 aa  206  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.62 
 
 		 615 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  49.14 
 
 		 633 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.95 
 
 		 614 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.2 
 
 		 651 aa  204  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0494755  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.84 
 
 		 831 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.91 
 
 		 617 aa  198  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.77 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.68 
 
 		 571 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.51 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.3 
 
 		 585 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  28.5 
 
 		 583 aa  192  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.6 
 
 		 595 aa  190  8e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  44.22 
 
 		 610 aa  188  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3924  signal peptide peptidase A  30.38 
 
 		 682 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  29.93 
 
 		 593 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  40.32 
 
 		 618 aa  183  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.54 
 
 		 617 aa  182  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  40.21 
 
 		 618 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  40.56 
 
 		 618 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  37.37 
 
 		 616 aa  181  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  40.56 
 
 		 618 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  40.56 
 
 		 618 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  37.37 
 
 		 616 aa  180  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  40.21 
 
 		 618 aa  180  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>