More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1581 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.36 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.26 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.56 
 
 		 228 aa  177  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  45.79 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  44.74 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  43.68 
 
 		 198 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  41.21 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  42.35 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.74 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  43.16 
 
 		 198 aa  156  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.13 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.21 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  40.31 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  40.11 
 
 		 329 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 349 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  40.74 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  40.43 
 
 		 254 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  45.6 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  45.41 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  44.5 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  39.06 
 
 		 205 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.31 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  42.35 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  41.54 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  36.7 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  42.7 
 
 		 320 aa  131  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  40.1 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.34 
 
 		 210 aa  130  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 322 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.36 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.61 
 
 		 227 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.47 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.98 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  34.57 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  42.11 
 
 		 225 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  36.79 
 
 		 228 aa  124  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  34.57 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.97 
 
 		 233 aa  121  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  38.22 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.13 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  36.84 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2019  ThiJ/PfpI domain protein  47.87 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 324 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  39.47 
 
 		 224 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 324 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 324 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 338 aa  118  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.2 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 315 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  37.1 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  37.37 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 334 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  36.9 
 
 		 333 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 329 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.37 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  32.8 
 
 		 228 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  32.8 
 
 		 228 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.04 
 
 		 225 aa  114  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  33.67 
 
 		 284 aa  114  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 336 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.05 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 322 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  34.38 
 
 		 327 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.79 
 
 		 338 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 319 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.32 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 348 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 321 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 387 aa  111  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 328 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  39.27 
 
 		 338 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 341 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  37.1 
 
 		 322 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  39.39 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 323 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  34.78 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  34.78 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1902  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.37 
 
 		 747 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310197  hitchhiker  0.00633735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  34.05 
 
 		 344 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  36.41 
 
 		 329 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.29 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 321 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 336 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  39.47 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 358 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  36.17 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3881  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  36.36 
 
 		 331 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0354  ThiJ/PfpI  34.15 
 
 		 225 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  36.84 
 
 		 324 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 		 327 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  38.02 
 
 		 321 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 320 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>