More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1580 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1580  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2856  hypothetical protein  51.79 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1664  hypothetical protein  49.78 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2971  hypothetical protein  50.67 
 
 		 356 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4311  hypothetical protein  50.22 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35240  hypothetical protein  50.22 
 
 		 356 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.788403 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3700  hypothetical protein  47.09 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4426  hypothetical protein  42.98 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0226053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3459  CTP synthase domain protein  44.89 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3240  hypothetical protein  44.44 
 
 		 240 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0678648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4529  CTP synthase  46.12 
 
 		 251 aa  177  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.613298 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  30.99 
 
 		 535 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  33.74 
 
 		 560 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2990  CTP synthase  34.02 
 
 		 563 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  33.47 
 
 		 550 aa  108  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  32.11 
 
 		 563 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  30.54 
 
 		 531 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  33.75 
 
 		 558 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0760  CTP synthase  34.3 
 
 		 562 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  33.47 
 
 		 546 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  30.74 
 
 		 543 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2836  CTP synthase  33.06 
 
 		 559 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0206831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2349  CTP synthetase  34.3 
 
 		 567 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00181138  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  33.33 
 
 		 551 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  32.37 
 
 		 554 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  34.32 
 
 		 547 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  30.36 
 
 		 549 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  33.33 
 
 		 547 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  31.75 
 
 		 550 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  29.02 
 
 		 543 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  29.02 
 
 		 543 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1664  CTP synthase  32.49 
 
 		 553 aa  101  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  31.36 
 
 		 534 aa  101  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  32.07 
 
 		 565 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  32.23 
 
 		 568 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  30.93 
 
 		 539 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  32.64 
 
 		 552 aa  99.4  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0919  CTP synthetase  29.03 
 
 		 533 aa  99.4  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  31.4 
 
 		 532 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  30 
 
 		 550 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00220  CTP synthase, putative  32.62 
 
 		 625 aa  99  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  29.41 
 
 		 543 aa  99  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  29.08 
 
 		 541 aa  99  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  31.71 
 
 		 538 aa  98.6  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0862  CTP synthetase  33.47 
 
 		 546 aa  98.6  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  30.71 
 
 		 559 aa  98.6  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  27.94 
 
 		 545 aa  98.2  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3141  CTP synthetase  30.45 
 
 		 572 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151944  normal  0.766797 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  32.07 
 
 		 530 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1282  CTP synthetase  29.51 
 
 		 534 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0045  CTP synthase  32.17 
 
 		 546 aa  97.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  28.74 
 
 		 546 aa  97.1  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  29.67 
 
 		 536 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  32.93 
 
 		 581 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1984  CTP synthetase  31.3 
 
 		 531 aa  96.7  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  32.78 
 
 		 608 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4200  CTP synthetase  32.93 
 
 		 542 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  29.8 
 
 		 535 aa  96.3  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  29.8 
 
 		 535 aa  96.3  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  29.39 
 
 		 544 aa  96.7  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  27.71 
 
 		 536 aa  96.3  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  27.71 
 
 		 536 aa  96.3  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  32.2 
 
 		 533 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  32.22 
 
 		 535 aa  95.9  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  30.74 
 
 		 558 aa  95.9  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0904  CTP synthetase  29.39 
 
 		 521 aa  95.9  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000256571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  31.51 
 
 		 558 aa  95.5  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  27.89 
 
 		 547 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  28.05 
 
 		 547 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_002950  PG0525  CTP synthetase  30.21 
 
 		 539 aa  95.1  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  31.62 
 
 		 531 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  30.58 
 
 		 536 aa  95.1  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  29.79 
 
 		 542 aa  95.1  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  30.61 
 
 		 545 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0899  CTP synthetase  29.8 
 
 		 558 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.995561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  27.46 
 
 		 535 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1691  CTP synthetase  29.92 
 
 		 553 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2713  CTP synthetase  29.92 
 
 		 553 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  29.92 
 
 		 553 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  29.92 
 
 		 553 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  29.92 
 
 		 553 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  29.92 
 
 		 553 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  33.19 
 
 		 551 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  32.63 
 
 		 540 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  29.34 
 
 		 539 aa  94  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  29.92 
 
 		 570 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  30.93 
 
 		 558 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  31.4 
 
 		 537 aa  93.6  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  31.3 
 
 		 535 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  29.27 
 
 		 542 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  29.92 
 
 		 549 aa  93.2  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  31.23 
 
 		 535 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1730  CTP synthase  30.74 
 
 		 555 aa  92.8  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14180  CTP synthetase  37.36 
 
 		 563 aa  92.8  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.609851  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  29.11 
 
 		 538 aa  92.8  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  29.63 
 
 		 543 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  29.66 
 
 		 540 aa  92.8  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2080  CTP synthetase  29.13 
 
 		 542 aa  92.4  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  29.92 
 
 		 553 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3181  CTP synthetase  30.8 
 
 		 547 aa  92.4  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>