More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0904 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0904  CTP synthetase  100 
 
 
521 aa  1073    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000256571 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  50.74 
 
 
544 aa  549  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  50.74 
 
 
544 aa  545  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  50.37 
 
 
548 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  51.11 
 
 
550 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  49.82 
 
 
547 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  50.83 
 
 
549 aa  538  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  49.82 
 
 
543 aa  536  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  52.38 
 
 
533 aa  537  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  51.02 
 
 
553 aa  529  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  49.91 
 
 
534 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  50.47 
 
 
533 aa  530  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  52.28 
 
 
547 aa  528  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  49.82 
 
 
557 aa  528  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  50.95 
 
 
537 aa  527  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  51.02 
 
 
546 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  50.28 
 
 
546 aa  522  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  48.98 
 
 
543 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0152  CTP synthetase  51.11 
 
 
543 aa  522  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899365  normal  0.0316034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  51.14 
 
 
539 aa  522  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  52.24 
 
 
535 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  50.94 
 
 
545 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  50.37 
 
 
550 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  50.19 
 
 
539 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  49.54 
 
 
543 aa  521  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  50.66 
 
 
541 aa  519  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  51.42 
 
 
545 aa  518  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  50.74 
 
 
542 aa  518  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  51.13 
 
 
533 aa  518  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  50.37 
 
 
550 aa  518  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  49.53 
 
 
536 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  51.32 
 
 
530 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  50.66 
 
 
547 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  48.89 
 
 
543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  50 
 
 
546 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  52.08 
 
 
533 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  48.79 
 
 
542 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  50.38 
 
 
531 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  48.87 
 
 
548 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  50.47 
 
 
547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  49.24 
 
 
558 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  49.35 
 
 
545 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  50.47 
 
 
535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  50.47 
 
 
535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  52.58 
 
 
534 aa  517  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  50.57 
 
 
533 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  51.18 
 
 
559 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  51.33 
 
 
542 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  48.8 
 
 
542 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  48.8 
 
 
542 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  48.61 
 
 
552 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  51.21 
 
 
540 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  47.97 
 
 
543 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  50.18 
 
 
545 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  47.99 
 
 
555 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  48.8 
 
 
551 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0608  CTP synthetase  50.37 
 
 
553 aa  513  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.235124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  49.72 
 
 
538 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  51.13 
 
 
537 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  50.27 
 
 
563 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  49.07 
 
 
538 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  50.09 
 
 
558 aa  514  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  49.91 
 
 
534 aa  512  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  48.61 
 
 
547 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0525  CTP synthetase  48.51 
 
 
539 aa  509  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  48.99 
 
 
555 aa  508  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  48.8 
 
 
542 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  50.56 
 
 
542 aa  511  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  48.43 
 
 
542 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  50.28 
 
 
544 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2054  CTP synthetase  50.65 
 
 
542 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  50.18 
 
 
545 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  49.62 
 
 
539 aa  510  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1088  CTP synthetase  49.91 
 
 
550 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  49.36 
 
 
546 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  50 
 
 
566 aa  508  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  50.28 
 
 
532 aa  511  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  47.51 
 
 
542 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  51.68 
 
 
536 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3443  CTP synthetase  49.82 
 
 
559 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  50.46 
 
 
555 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  50.93 
 
 
543 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  50 
 
 
552 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  49.91 
 
 
542 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  49.44 
 
 
535 aa  509  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1170  CTP synthetase  50.37 
 
 
543 aa  510  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.251518  normal  0.0605368 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  48.99 
 
 
571 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  48.33 
 
 
540 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  49.82 
 
 
542 aa  509  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  51.14 
 
 
533 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  47.51 
 
 
542 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  50.57 
 
 
554 aa  510  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  50.09 
 
 
547 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  47.05 
 
 
543 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  48.87 
 
 
531 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  50.09 
 
 
532 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  50.09 
 
 
552 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  50 
 
 
566 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  48.24 
 
 
543 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1833  CTP synthetase  50.56 
 
 
543 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392945  normal  0.73431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>