More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2080 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0045  CTP synthase  68.09 
 
 		 546 aa  773    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2084  CTP synthetase  67.72 
 
 		 544 aa  771    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0736609  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  65.79 
 
 		 543 aa  745    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  65.61 
 
 		 541 aa  752    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2080  CTP synthetase  100 
 
 		 542 aa  1112    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  64.49 
 
 		 545 aa  731    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  65.79 
 
 		 543 aa  744    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  65.79 
 
 		 543 aa  745    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  67.17 
 
 		 546 aa  767    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  65.3 
 
 		 544 aa  751    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  53.11 
 
 		 546 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  53.7 
 
 		 531 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  53.52 
 
 		 531 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  53.05 
 
 		 535 aa  585  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  53.05 
 
 		 535 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  53.05 
 
 		 535 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  53.15 
 
 		 535 aa  585  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  53.07 
 
 		 550 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  52.68 
 
 		 535 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  52.87 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  53.79 
 
 		 546 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  52.87 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  52.87 
 
 		 535 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  52.87 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  53.16 
 
 		 557 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  52.68 
 
 		 535 aa  581  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  53.14 
 
 		 555 aa  578  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  52.68 
 
 		 535 aa  581  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  51.76 
 
 		 542 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  51.48 
 
 		 552 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  53.07 
 
 		 543 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  50.74 
 
 		 555 aa  575  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  53.33 
 
 		 533 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  50.55 
 
 		 555 aa  576  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  53.16 
 
 		 555 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  51.76 
 
 		 547 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  52.79 
 
 		 536 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  51.95 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  52.97 
 
 		 555 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  52.04 
 
 		 548 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  52.97 
 
 		 555 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  52.69 
 
 		 530 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  51.94 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  51.39 
 
 		 549 aa  569  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  52.02 
 
 		 541 aa  570  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  52.01 
 
 		 555 aa  568  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  52.42 
 
 		 538 aa  571  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  52.01 
 
 		 557 aa  570  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  52.13 
 
 		 546 aa  571  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  52.59 
 
 		 543 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  51.85 
 
 		 540 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  50.28 
 
 		 555 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03082  CTP synthetase  52.99 
 
 		 543 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000772842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  50.47 
 
 		 534 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  52.21 
 
 		 533 aa  567  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  51.77 
 
 		 555 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  52.24 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  49.91 
 
 		 542 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  51.49 
 
 		 550 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  51.65 
 
 		 547 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3387  CTP synthetase  52.49 
 
 		 545 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0942417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  50.28 
 
 		 542 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  51.77 
 
 		 534 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3546  CTP synthetase  52.49 
 
 		 545 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  51.12 
 
 		 547 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  52.31 
 
 		 532 aa  561  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  53.43 
 
 		 533 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  51.47 
 
 		 535 aa  560  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  51.65 
 
 		 545 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  51.65 
 
 		 545 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3111  CTP synthetase  51.68 
 
 		 545 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  51.12 
 
 		 550 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  52.71 
 
 		 545 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  51.85 
 
 		 536 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  52.71 
 
 		 545 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  51.87 
 
 		 545 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  51.75 
 
 		 535 aa  558  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  53.43 
 
 		 533 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3150  CTP synthetase  51.68 
 
 		 545 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858121  normal  0.288938 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  52.71 
 
 		 545 aa  560  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3086  CTP synthetase  51.68 
 
 		 545 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3267  CTP synthetase  51.68 
 
 		 545 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0428959 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  51.19 
 
 		 536 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  51.58 
 
 		 547 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  49.45 
 
 		 533 aa  558  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  51.68 
 
 		 545 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  51.49 
 
 		 540 aa  560  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0851  CTP synthetase  52.79 
 
 		 545 aa  561  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  51.48 
 
 		 539 aa  560  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  51.19 
 
 		 536 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  51.12 
 
 		 546 aa  555  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  50.09 
 
 		 543 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0817  CTP synthetase  52.12 
 
 		 545 aa  557  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.351659  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  53.35 
 
 		 566 aa  558  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  49.91 
 
 		 542 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  51.47 
 
 		 544 aa  556  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  51.12 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  51.3 
 
 		 546 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  51.12 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  50.93 
 
 		 534 aa  555  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>