More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1191 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1191  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  519  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4474  two component transcriptional regulator  72.66 
 
 		 256 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2855  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20037  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.36 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.4 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  29.79 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5869  two component transcriptional regulator  31.69 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  30.29 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5652  two component transcriptional regulator  31.69 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0393139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.96 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3765  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.38 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.757734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  28.17 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  30.16 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3919  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.34 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1576  response regulator receiver  30.73 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  0.0547836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1855  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.73 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  31.63 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  33.95 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3997  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.32 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.63 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1663  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.73 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3856  two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  31.12 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  25.21 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  28.84 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  32.39 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  24.79 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.93 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  24.79 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0766  DNA-binding response regulator  37.67 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.94 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  31.07 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.88 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4227  two component response regulator  30.99 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0109817  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.94 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.15 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.46 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.63 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4105  two component transcriptional regulator  33.14 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0417  two component transcriptional regulator  31.95 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1493  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.91 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  28.3 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  30.8 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  33.02 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  31.03 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  29.08 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  26.47 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  31.03 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  27.46 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  32.18 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2374  two component transcriptional regulator  27.44 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  24.37 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0244  two component transcriptional regulator, winged helix family  25 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  25.21 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2950  two component transcriptional regulator  26.15 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  30.19 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  24.79 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  25.21 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  27.44 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  30.59 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  27.05 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.29 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0076  two component transcriptional regulator  30.19 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  25.31 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.25 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  25.31 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  26.05 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  28.38 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4388  DNA-binding response regulator  29.17 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2178  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  27.78 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2505  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472327  normal  0.764107 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1614  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  30.52 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2261  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0660  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0847  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0654  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  28.31 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1975  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0150258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  30.41 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3056  two component transcriptional regulator  29.65 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1771  two component transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.046286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>