280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4699 on replicon NC_009671
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009671  Oant_4699  UbiD family decarboxylase  100 
 
 		 443 aa  917    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1167  carboxylyase-like protein  78.38 
 
 		 447 aa  721    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4939  UbiD family decarboxylase  87.1 
 
 		 443 aa  817    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1108  carboxylyase-like protein  48.95 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0078  UbiD family decarboxylase  47.85 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1121  carboxylyase-like protein  47.32 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3609  UbiD family decarboxylase  35.18 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7527  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  34.25 
 
 		 455 aa  212  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0636  carboxylyase-like protein  33.03 
 
 		 464 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3994  UbiD family decarboxylase  33.26 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247967  normal  0.0822542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0716  4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.88 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0843  carboxylyase-like protein  31.47 
 
 		 472 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2071  carboxylyase-like protein  33.26 
 
 		 494 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.15 
 
 		 522 aa  196  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3716  UbiD family decarboxylase  31.6 
 
 		 469 aa  196  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7140  UbiD family decarboxylase  32.77 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493954  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6675  UbiD family decarboxylase  33.72 
 
 		 506 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4732  UbiD family decarboxylase  31.82 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  31.12 
 
 		 487 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1473  carboxylyase-like protein  29.86 
 
 		 425 aa  192  8e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0383556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  31.32 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3999  UbiD family decarboxylase  33.49 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1310  UbiD family decarboxylase  33.02 
 
 		 469 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2187  UbiD family decarboxylase  33.26 
 
 		 494 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3071  carboxylyase-like protein  32.53 
 
 		 474 aa  190  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0542866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3430  carboxylyase-like protein  32.28 
 
 		 461 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540081  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.18 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.55 
 
 		 509 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1386  UbiD family decarboxylase  31.55 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4788  UbiD family decarboxylase  31.62 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.46 
 
 		 482 aa  187  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  29.85 
 
 		 502 aa  186  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.07 
 
 		 502 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.5 
 
 		 489 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.37 
 
 		 492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.37 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  29.85 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  29.94 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0533  UbiD family decarboxylase  30.6 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.59 
 
 		 497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  29.85 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.37 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.37 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.42 
 
 		 490 aa  184  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.2 
 
 		 521 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.07 
 
 		 491 aa  182  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0305  UbiD family decarboxylase  30.83 
 
 		 425 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  29.24 
 
 		 481 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.96 
 
 		 495 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.37 
 
 		 492 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.37 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  29.37 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.37 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.37 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  32.37 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0014  UbiD family decarboxylase  30.39 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  29.37 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.63 
 
 		 490 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.37 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.96 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.96 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  28.29 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.37 
 
 		 497 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.16 
 
 		 497 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  28.01 
 
 		 491 aa  179  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  29.16 
 
 		 488 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  30.56 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.42 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  30.41 
 
 		 488 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  30.02 
 
 		 488 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.91 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  29.98 
 
 		 520 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  30.56 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  29.53 
 
 		 488 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.7 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  28.94 
 
 		 550 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  28.94 
 
 		 488 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  29.04 
 
 		 498 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1526  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.22 
 
 		 536 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74472  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0404  UbiD family decarboxylase  35.41 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.22 
 
 		 488 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  29.59 
 
 		 487 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  28.73 
 
 		 498 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  31.57 
 
 		 481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1419  carboxylyase-like protein  31.31 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.83 
 
 		 488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.81 
 
 		 488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.51 
 
 		 501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2591  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.02 
 
 		 578 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0381  carboxylyase-like protein  29.59 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0758  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.02 
 
 		 519 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176704  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2151  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.02 
 
 		 519 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  29 
 
 		 492 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3106  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.02 
 
 		 578 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.02 
 
 		 519 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3075  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.02 
 
 		 519 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.02 
 
 		 519 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79917  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0598  UbiD family decarboxylase  30.34 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  29.57 
 
 		 493 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  29.63 
 
 		 493 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>