More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3945 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  308  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  91.45 
 
 
154 aa  286  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  90.79 
 
 
154 aa  284  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  67.11 
 
 
152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  67.11 
 
 
152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  67.11 
 
 
152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  67.11 
 
 
152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  66.89 
 
 
152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  66.89 
 
 
177 aa  214  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  66.89 
 
 
152 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  66.89 
 
 
154 aa  214  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  66.89 
 
 
152 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  66.89 
 
 
152 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  64.47 
 
 
152 aa  207  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  60.67 
 
 
155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 
155 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  58.55 
 
 
154 aa  193  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 
155 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 
155 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 
155 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  58.28 
 
 
154 aa  191  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 
154 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 
154 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 
154 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 
154 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 
153 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
163 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
181 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
156 aa  144  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 
157 aa  142  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  46.05 
 
 
157 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
157 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
154 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
153 aa  140  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
156 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
155 aa  139  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
160 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
154 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  47.37 
 
 
155 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
152 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
153 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  46.04 
 
 
147 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
157 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 
154 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
152 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
157 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
174 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.67 
 
 
153 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
158 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.72 
 
 
155 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
157 aa  130  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 
175 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
154 aa  126  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
163 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  39.47 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
156 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
161 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  41.06 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.74 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
161 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
161 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
161 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
155 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
153 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
152 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
155 aa  123  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.82 
 
 
156 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>