More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3366 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  100 
 
 
433 aa  871    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  51.26 
 
 
440 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  51.03 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  51.18 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  46.96 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  50 
 
 
439 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  50.35 
 
 
434 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
442 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.58 
 
 
442 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  51.23 
 
 
439 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  50.51 
 
 
443 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  50.49 
 
 
437 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  47.1 
 
 
442 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  47.45 
 
 
467 aa  343  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  43.5 
 
 
451 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  41.76 
 
 
432 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  42.35 
 
 
437 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  42.69 
 
 
429 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  42.69 
 
 
429 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  42.69 
 
 
429 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  42.45 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  42.45 
 
 
429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 
446 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  42.45 
 
 
429 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  41.97 
 
 
429 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  41.97 
 
 
429 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  43.6 
 
 
428 aa  322  8e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  41.73 
 
 
429 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  41.73 
 
 
429 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 
429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.68 
 
 
437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.03 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.78 
 
 
442 aa  319  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 
440 aa  319  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.68 
 
 
436 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  43.88 
 
 
432 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  41.45 
 
 
454 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
455 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  42.72 
 
 
433 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  41.07 
 
 
450 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.95 
 
 
441 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  42.96 
 
 
432 aa  315  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  44.55 
 
 
441 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 
440 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  40.79 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  41.63 
 
 
452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.94 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  40.1 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  40.55 
 
 
450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  40.27 
 
 
455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  41.06 
 
 
442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.45 
 
 
442 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  41.22 
 
 
448 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  39.49 
 
 
449 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  41.22 
 
 
448 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  41.22 
 
 
448 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  41.73 
 
 
437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 
444 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 
440 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  41.88 
 
 
443 aa  308  9e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  41.65 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  41.65 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  43.47 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  40.98 
 
 
433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  41.65 
 
 
441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  43.03 
 
 
441 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  38.98 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  42.27 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 
444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  43.06 
 
 
434 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  42.03 
 
 
433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.48 
 
 
439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.82 
 
 
434 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 
443 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  43.54 
 
 
434 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  43.86 
 
 
439 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 
444 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 
439 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40.96 
 
 
445 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 
430 aa  299  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  39.9 
 
 
433 aa  300  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  41.69 
 
 
434 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  41.89 
 
 
469 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  41.69 
 
 
434 aa  299  7e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.76 
 
 
437 aa  299  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.89 
 
 
440 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  41.89 
 
 
440 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  41.89 
 
 
440 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  41.89 
 
 
440 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.89 
 
 
440 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  40.98 
 
 
446 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  42.58 
 
 
434 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  37.93 
 
 
445 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.2 
 
 
443 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  40.68 
 
 
441 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  42.58 
 
 
434 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  42.58 
 
 
434 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  38.44 
 
 
462 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  41.69 
 
 
434 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  42.82 
 
 
437 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>