54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2900 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  100 
 
 
146 aa  295  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  81.51 
 
 
168 aa  231  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  81.51 
 
 
146 aa  231  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  57.93 
 
 
147 aa  175  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  63.56 
 
 
147 aa  168  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  50.71 
 
 
151 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  46.53 
 
 
151 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  49.26 
 
 
173 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  53.39 
 
 
146 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  50.4 
 
 
150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  52.1 
 
 
187 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  51.91 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  49.26 
 
 
147 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  46.4 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  45.6 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  45.3 
 
 
144 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  49.15 
 
 
163 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  59.05 
 
 
149 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  50.44 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  45.97 
 
 
150 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  43.97 
 
 
144 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  46.67 
 
 
152 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  46.67 
 
 
152 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  44.44 
 
 
141 aa  114  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  44 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  50.55 
 
 
144 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  41.73 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  38.64 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  39.26 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  40.34 
 
 
143 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  40.85 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  45.54 
 
 
161 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  33.96 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  33.7 
 
 
255 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  35.24 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  35.24 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  30.4 
 
 
125 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  34.02 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  32 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  31.58 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  27.93 
 
 
173 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  26.42 
 
 
292 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  30.48 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  26.56 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  30.23 
 
 
172 aa  43.5  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  27.07 
 
 
221 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  25.55 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  25.38 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  32.61 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  31.76 
 
 
347 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  27.34 
 
 
126 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  28.74 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  32.39 
 
 
192 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  30.68 
 
 
209 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>