More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2506 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  86.73 
 
 
196 aa  361  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  87.11 
 
 
195 aa  359  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  74.03 
 
 
187 aa  291  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  69.02 
 
 
191 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  68.48 
 
 
191 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  68.13 
 
 
189 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  61.88 
 
 
191 aa  251  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  44.39 
 
 
196 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  52.94 
 
 
220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  49.33 
 
 
219 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  50 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  51.55 
 
 
238 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  50 
 
 
234 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  50 
 
 
235 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  47.97 
 
 
247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  49.33 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  40.49 
 
 
195 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  48 
 
 
192 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  48 
 
 
192 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  47.33 
 
 
192 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  47.33 
 
 
190 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  46.45 
 
 
190 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  44.03 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  43.14 
 
 
186 aa  134  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  36.46 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  41.67 
 
 
193 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  41.45 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  42.67 
 
 
221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  35.71 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  40.67 
 
 
153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  42.38 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  39.47 
 
 
200 aa  111  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  35.16 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  37.33 
 
 
185 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  36.88 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  36.88 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  43.05 
 
 
196 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  34.78 
 
 
177 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.9 
 
 
193 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  35.29 
 
 
177 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  36.14 
 
 
178 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  34.57 
 
 
184 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  36 
 
 
152 aa  98.2  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  32.05 
 
 
192 aa  91.7  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  35.03 
 
 
232 aa  89.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  33.72 
 
 
455 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  33.14 
 
 
455 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  31.82 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  40 
 
 
439 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  36.09 
 
 
419 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  34.03 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  34.17 
 
 
249 aa  84  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  42.45 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  42.45 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  37.23 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  36.29 
 
 
426 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  28.64 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  32.54 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  34.75 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  34.64 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  37.19 
 
 
459 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  28.5 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  34.44 
 
 
264 aa  74.7  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  35.29 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  36.13 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  33.94 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  29.88 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  35.71 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  32.52 
 
 
461 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  36.36 
 
 
816 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  30.33 
 
 
435 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  34.42 
 
 
441 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  38.71 
 
 
411 aa  71.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  32.03 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  32.3 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  38.46 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  32.3 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  28.79 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  38.4 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  38.4 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  34.71 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  34.06 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.49 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  32.67 
 
 
358 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  33.61 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  30.85 
 
 
478 aa  68.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  28.24 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  29.95 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  32.82 
 
 
253 aa  67.8  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  32.33 
 
 
270 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  30.67 
 
 
410 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  32.72 
 
 
869 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  33.87 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.6 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  35.04 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  32.62 
 
 
417 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  34.35 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  34.56 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  38.39 
 
 
451 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>