72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0447 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0447  porin  100 
 
 		 379 aa  763    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  69.07 
 
 		 372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  73.48 
 
 		 372 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  67.97 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  57.77 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  60.55 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  56.27 
 
 		 391 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  55.03 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  41.97 
 
 		 406 aa  323  4e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0939  porin  32.77 
 
 		 401 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  34.63 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  32.83 
 
 		 480 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  34.72 
 
 		 506 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  33.96 
 
 		 488 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  34.09 
 
 		 484 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  29 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  31.54 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  34.29 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  28.89 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  31.49 
 
 		 502 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  35.44 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  33.33 
 
 		 483 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  37.93 
 
 		 499 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  33.21 
 
 		 495 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  29 
 
 		 521 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  32.41 
 
 		 512 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  33.63 
 
 		 522 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  34.73 
 
 		 484 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  39.15 
 
 		 522 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  39.15 
 
 		 527 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  29.53 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  36.94 
 
 		 488 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  31.88 
 
 		 553 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  32.53 
 
 		 546 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  31.06 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  39.68 
 
 		 521 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  27.97 
 
 		 498 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  38.07 
 
 		 553 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  31.22 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  34.13 
 
 		 498 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  37.17 
 
 		 553 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  37.17 
 
 		 553 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  31.17 
 
 		 338 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  30.36 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  34.09 
 
 		 533 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  26.42 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  34.67 
 
 		 559 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  34.21 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  33.61 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  27.25 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  37.12 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  42.18 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  41.03 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  26.67 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  29.17 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  29.17 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  29.56 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  30.49 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  30.34 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  28.03 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  36.94 
 
 		 550 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  36.07 
 
 		 551 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  31.05 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  59.02 
 
 		 561 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  30.59 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  33.98 
 
 		 560 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  26.69 
 
 		 513 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  30.73 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  25.31 
 
 		 560 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  32.35 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  32.03 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>