165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0676 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 320 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  62.1 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  56.63 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  56.39 
 
 		 319 aa  295  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  55.34 
 
 		 323 aa  285  8e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  46.5 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  40.89 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.14 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  42.49 
 
 		 320 aa  202  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  42.53 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.91 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.33 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.19 
 
 		 331 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.93 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.18 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.47 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.47 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  39.67 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.55 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.88 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.88 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  40.88 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.56 
 
 		 1343 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1094 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1181 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  30.71 
 
 		 1148 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  26.15 
 
 		 958 aa  99.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.21 
 
 		 510 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.25 
 
 		 1224 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  29.31 
 
 		 546 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.33 
 
 		 1438 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  25.81 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  28.45 
 
 		 644 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  27.73 
 
 		 959 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.9 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.24 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  26.39 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.03 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.63 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.03 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  31.38 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 		 593 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  31.77 
 
 		 886 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.09 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.73 
 
 		 390 aa  67  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.16 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.27 
 
 		 1139 aa  66.2  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.63 
 
 		 223 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.93 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  31.28 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  29.63 
 
 		 838 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  29.26 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.29 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.56 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  32.07 
 
 		 773 aa  62.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.62 
 
 		 157 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.03 
 
 		 173 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.73 
 
 		 524 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.1 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  31.88 
 
 		 1133 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.09 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.17 
 
 		 642 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.98 
 
 		 666 aa  59.3  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  34.01 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.98 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.32 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.33 
 
 		 670 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  31.71 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  28.35 
 
 		 643 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.86 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  28.09 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1391  HEAT domain containing protein  27.31 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.99 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  41.3 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.38 
 
 		 951 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.95 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.55 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.98 
 
 		 641 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.82 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.53 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  28.91 
 
 		 1328 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.41 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.83 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  24.45 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.3 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1322  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.5 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.488747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.45 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.6 
 
 		 824 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.82 
 
 		 642 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0517  hypothetical protein  38.37 
 
 		 124 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302016  normal  0.633318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 157 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.39 
 
 		 408 aa  52.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.38 
 
 		 215 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0029  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.76 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158294  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.41 
 
 		 176 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.71 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.71 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>