More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2315 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2315  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 298 aa  586  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  53.92 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  54.45 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  54.55 
 
 		 308 aa  271  7e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  54.27 
 
 		 308 aa  268  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  53.02 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  51.01 
 
 		 321 aa  261  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  54.26 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  51.37 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  49.33 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 302 aa  255  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 307 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  48.84 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 303 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  51.36 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1229  dihydrodipicolinate synthase  52.84 
 
 		 303 aa  246  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 292 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  48.83 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  48.3 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  50.84 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 325 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  48.61 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  42.65 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  41.75 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 		 292 aa  222  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 		 292 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  41.75 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  47.8 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  40.2 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  44.26 
 
 		 314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  39.8 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  39.8 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  44.53 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  43.2 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 		 294 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  38.52 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  40.77 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  40.77 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  39.6 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  41.61 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  38.78 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  40.86 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  39.46 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  40.86 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  42.7 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  42.7 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  40.78 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  43.93 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4273  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  46.01 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  38.87 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  36.52 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  36.03 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  38.78 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  38.78 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  37.98 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  37.09 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  41.54 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  38.78 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  37.09 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  36.95 
 
 		 296 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  36.69 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  35.59 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>