56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2174 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2174  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 133 aa  255  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 176 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  29.63 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4895  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  27.78 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.33 
 
 		 325 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  40.22 
 
 		 292 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  42.68 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 159 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 149 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 159 aa  40  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  31.82 
 
 		 153 aa  40  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 156 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 185 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>