More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1319 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  100 
 
 		 384 aa  751    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  47.4 
 
 		 367 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  45.24 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  43.18 
 
 		 393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  42.56 
 
 		 425 aa  229  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.01 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  39.51 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  41.88 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.87 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.46 
 
 		 419 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 449 aa  212  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  36.21 
 
 		 424 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 469 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  44.65 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  39.62 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.47 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 430 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 435 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  39.32 
 
 		 403 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 424 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  36.15 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.89 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  43.56 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  45.75 
 
 		 438 aa  152  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  41.14 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.96 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  42.35 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.21 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  44.53 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  37.29 
 
 		 420 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.58 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  36.09 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  40.68 
 
 		 395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  35.07 
 
 		 374 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02410  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 428 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  34.96 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  37.98 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 536 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 413 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  41.96 
 
 		 555 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  35.96 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  33.43 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  36.78 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  36.84 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  31.34 
 
 		 422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  39.17 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.64 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  39.59 
 
 		 421 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  35.96 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  32.84 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.82 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  36.76 
 
 		 445 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  32.8 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  37.5 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  31.58 
 
 		 470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  32.29 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  31.81 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  37.45 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.46 
 
 		 424 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.75 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 612 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.86 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.98 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  36.53 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  38.02 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.38 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  34.55 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  31.41 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  31.43 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  33.93 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  33.9 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  40.29 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  36.28 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  38.16 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  35.77 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  31.9 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  30.96 
 
 		 447 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21610  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>