More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1270 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  100 
 
 		 419 aa  852    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  29.17 
 
 		 477 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  29.38 
 
 		 379 aa  146  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20310  metalloendopeptidase-like membrane protein  28.26 
 
 		 446 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  29.15 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.73 
 
 		 376 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  23.82 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  23.13 
 
 		 441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  23.58 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  22.87 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  29.74 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  28.4 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  28.96 
 
 		 474 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.83 
 
 		 462 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  31.62 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  45.08 
 
 		 489 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  27.89 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1246  Peptidase M23  43.9 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  28.2 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  27 
 
 		 379 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.66 
 
 		 287 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  27.7 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  25.62 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  29.55 
 
 		 375 aa  113  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  46.15 
 
 		 697 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  44.62 
 
 		 674 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  46.15 
 
 		 697 aa  112  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  27.47 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  26.64 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  45.38 
 
 		 699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  46.15 
 
 		 676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  40.14 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  27.51 
 
 		 374 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  45.38 
 
 		 681 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  25.12 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  25.67 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  27.05 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  31.23 
 
 		 372 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  45.53 
 
 		 253 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  44.44 
 
 		 464 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  42.15 
 
 		 683 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  40.77 
 
 		 621 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  41.54 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  46.56 
 
 		 648 aa  103  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  44.96 
 
 		 646 aa  102  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  43.31 
 
 		 651 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2663  peptidase M23B  29.23 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  40.77 
 
 		 615 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  42.5 
 
 		 665 aa  101  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  45 
 
 		 276 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  28 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  40.17 
 
 		 465 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  42.4 
 
 		 651 aa  100  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  42.4 
 
 		 651 aa  100  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  42.86 
 
 		 524 aa  99.8  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  40.6 
 
 		 527 aa  99.8  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  34.94 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  44.53 
 
 		 290 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  42.86 
 
 		 695 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  42.86 
 
 		 137 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  34.34 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  40.83 
 
 		 439 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  34.94 
 
 		 391 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  40 
 
 		 440 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  40.62 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2767  Peptidase M23  29.62 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.327973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  43.08 
 
 		 569 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  34.88 
 
 		 290 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  39.29 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  41.54 
 
 		 640 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  31.94 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  33.63 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  29.18 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  41.54 
 
 		 640 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  36.67 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  42.19 
 
 		 538 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  41.6 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  36.8 
 
 		 314 aa  94  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  41.86 
 
 		 645 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  34.83 
 
 		 482 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  40.68 
 
 		 457 aa  93.2  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  34.86 
 
 		 316 aa  93.2  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  39.69 
 
 		 324 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  38.66 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  42.5 
 
 		 692 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  42.74 
 
 		 454 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  42.74 
 
 		 454 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  36.84 
 
 		 330 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  43.41 
 
 		 656 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  44.44 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  39.53 
 
 		 676 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  40.31 
 
 		 690 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  39.53 
 
 		 680 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  41.09 
 
 		 695 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  39.53 
 
 		 681 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  31.28 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  37.4 
 
 		 735 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  37.5 
 
 		 455 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  35.47 
 
 		 445 aa  90.1  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  28.9 
 
 		 446 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>