More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1073 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  100 
 
 
328 aa  654    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  51.95 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  48.53 
 
 
320 aa  318  7e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  46.37 
 
 
352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  46.13 
 
 
328 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  47.28 
 
 
397 aa  299  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  47.28 
 
 
397 aa  299  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  47.65 
 
 
322 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  48.05 
 
 
396 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  45.78 
 
 
347 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  50.16 
 
 
367 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  49.37 
 
 
386 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  47 
 
 
322 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  45.57 
 
 
348 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  47.78 
 
 
386 aa  288  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  46.15 
 
 
351 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  47.08 
 
 
347 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  47.08 
 
 
347 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  48.87 
 
 
388 aa  286  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  48.87 
 
 
388 aa  285  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  43.45 
 
 
386 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  48.7 
 
 
386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  44.48 
 
 
318 aa  282  7.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  45.77 
 
 
374 aa  281  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  45.19 
 
 
359 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  43.09 
 
 
330 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  47.9 
 
 
373 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  46.93 
 
 
375 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  47.9 
 
 
324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  45.89 
 
 
322 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  43 
 
 
317 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  49.35 
 
 
406 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  42.72 
 
 
414 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  44.05 
 
 
359 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  41.78 
 
 
384 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  46.13 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  45.93 
 
 
317 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  41.43 
 
 
351 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  39.73 
 
 
356 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  37.78 
 
 
325 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  37.42 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2212  ribonuclease BN, putative  37.13 
 
 
307 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601428  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  36.63 
 
 
332 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  41.58 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  39.69 
 
 
313 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  36.33 
 
 
283 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  35.69 
 
 
310 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  37.27 
 
 
328 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  36.3 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  33.68 
 
 
402 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  31.96 
 
 
293 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  31.94 
 
 
363 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  30.82 
 
 
359 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  31.1 
 
 
334 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  32.98 
 
 
377 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  33.45 
 
 
278 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  32.33 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  32.8 
 
 
333 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  35.64 
 
 
371 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  33.45 
 
 
401 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  33.1 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2846  putative ribonuclease BN  33.1 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  31.85 
 
 
330 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  32 
 
 
299 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  30.91 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  31.08 
 
 
288 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  31.08 
 
 
288 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  33.22 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.85 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  30.43 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.43 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30.43 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  30.43 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  30.43 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30.43 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  31.48 
 
 
349 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  30.48 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  32.24 
 
 
316 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  31.85 
 
 
277 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  30.77 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  33.22 
 
 
338 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  33.22 
 
 
338 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  31.79 
 
 
317 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  32.57 
 
 
316 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  33.22 
 
 
350 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  33.22 
 
 
350 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  33.22 
 
 
350 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.42 
 
 
316 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  30.82 
 
 
328 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  28.42 
 
 
367 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  31.18 
 
 
283 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  31.56 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2706  ribonuclease BN  29.48 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.773085  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  31.36 
 
 
338 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  30.36 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  29.53 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  32.43 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  32.21 
 
 
301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  29.86 
 
 
304 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.97 
 
 
341 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>