113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4247 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  100 
 
 		 159 aa  327  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.13 
 
 		 372 aa  208  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.04 
 
 		 369 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.04 
 
 		 369 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.69 
 
 		 373 aa  187  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.41 
 
 		 370 aa  176  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.41 
 
 		 370 aa  176  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.41 
 
 		 370 aa  176  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  53.9 
 
 		 371 aa  174  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  53.9 
 
 		 403 aa  174  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.49 
 
 		 369 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.49 
 
 		 369 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.49 
 
 		 369 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.49 
 
 		 369 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  71.43 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.49 
 
 		 332 aa  167  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.19 
 
 		 369 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  50.64 
 
 		 229 aa  157  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  50 
 
 		 384 aa  153  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  50 
 
 		 265 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.97 
 
 		 376 aa  151  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.97 
 
 		 376 aa  151  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.29 
 
 		 359 aa  150  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  51.28 
 
 		 391 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  51.28 
 
 		 391 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  51.28 
 
 		 391 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  51.28 
 
 		 391 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  51.28 
 
 		 391 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  51.28 
 
 		 391 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  51.28 
 
 		 391 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  51.28 
 
 		 391 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  50.64 
 
 		 391 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  50.64 
 
 		 391 aa  145  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  50.64 
 
 		 391 aa  145  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  50.64 
 
 		 391 aa  145  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.34 
 
 		 366 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  44.87 
 
 		 384 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.66 
 
 		 376 aa  140  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  48.37 
 
 		 363 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.37 
 
 		 363 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  54.46 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 		 361 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  37.5 
 
 		 261 aa  84.3  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  37.5 
 
 		 368 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  37.5 
 
 		 368 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.34 
 
 		 374 aa  80.9  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  57.89 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  34.21 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  84.62 
 
 		 206 aa  70.5  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8273  transposase  28.28 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.19 
 
 		 340 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.19 
 
 		 340 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7300  putative transposase  30.77 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675476  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  26.49 
 
 		 411 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  26.49 
 
 		 411 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  26.49 
 
 		 411 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  26.49 
 
 		 411 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  26.49 
 
 		 411 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  26.49 
 
 		 411 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4141  putative transposase  34.85 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.67819  normal  0.487019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  28.66 
 
 		 406 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  28.66 
 
 		 406 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.21 
 
 		 330 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.346969 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  22.58 
 
 		 385 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.37 
 
 		 319 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.17 
 
 		 378 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  25.64 
 
 		 349 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  25.95 
 
 		 348 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01474  hypothetical protein  24.18 
 
 		 207 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  25.34 
 
 		 349 aa  44.3  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 		 348 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 		 348 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  24.18 
 
 		 347 aa  43.9  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  24.18 
 
 		 347 aa  43.9  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  24.18 
 
 		 347 aa  43.9  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  31.94 
 
 		 379 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.14 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  26.14 
 
 		 346 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  24.18 
 
 		 347 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  30.67 
 
 		 412 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1542  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.58 
 
 		 327 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00714409  hitchhiker  0.00689732 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02602  hypothetical protein  34.48 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02815  hypothetical protein  25.93 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06781  hypothetical protein  25.93 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0422  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.54 
 
 		 330 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0984  hypothetical protein  29.19 
 
 		 326 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  21.29 
 
 		 385 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  27.65 
 
 		 382 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.15 
 
 		 411 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.66 
 
 		 347 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.23 
 
 		 381 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.47 
 
 		 393 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.52 
 
 		 343 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.35 
 
 		 383 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 		 288 aa  40.8  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.79 
 
 		 406 aa  40.8  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2068  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.62 
 
 		 330 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>