139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06781 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  313  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  313  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  313  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  99.32 
 
 		 347 aa  309  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01474  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  308  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02815  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  304  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06781  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  304  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  76.87 
 
 		 347 aa  223  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  76.87 
 
 		 347 aa  223  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  74.15 
 
 		 347 aa  216  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  73.47 
 
 		 347 aa  216  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  72.79 
 
 		 347 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  61.9 
 
 		 348 aa  204  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  61.9 
 
 		 348 aa  204  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  61.9 
 
 		 349 aa  203  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  63.04 
 
 		 260 aa  202  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  60.69 
 
 		 349 aa  199  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  67.97 
 
 		 329 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00628  ISGsu4, transposase  67.97 
 
 		 238 aa  194  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000155742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  58.62 
 
 		 349 aa  192  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  55.1 
 
 		 397 aa  192  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  55.1 
 
 		 377 aa  191  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  54.42 
 
 		 377 aa  190  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  54.42 
 
 		 377 aa  190  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  54.42 
 
 		 377 aa  190  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  53.74 
 
 		 377 aa  187  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02021  hypothetical protein  96.47 
 
 		 85 aa  174  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02604  hypothetical protein  98.41 
 
 		 94 aa  133  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2393  ISGsu5, transposase, truncation  53.41 
 
 		 198 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.59 
 
 		 360 aa  87  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.59 
 
 		 360 aa  87  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.59 
 
 		 360 aa  87  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.82 
 
 		 339 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.82 
 
 		 339 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.82 
 
 		 339 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.82 
 
 		 339 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0277  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.51 
 
 		 336 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1029  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.77 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  30.3 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  31.06 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5379  putative transposase for insertion sequence element  27.34 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0576  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  71.43 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.91 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.91 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.91 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  25 
 
 		 362 aa  53.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  25 
 
 		 362 aa  53.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  25 
 
 		 362 aa  53.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  25 
 
 		 362 aa  53.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  25 
 
 		 362 aa  53.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  25 
 
 		 362 aa  53.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  29.08 
 
 		 414 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.2 
 
 		 393 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  30 
 
 		 343 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.06 
 
 		 340 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.06 
 
 		 340 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  26.24 
 
 		 414 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  30 
 
 		 343 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  24.14 
 
 		 310 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  31.01 
 
 		 266 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.95 
 
 		 350 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.29 
 
 		 367 aa  50.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.29 
 
 		 343 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 		 540 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 		 542 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 		 540 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 		 540 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  25 
 
 		 363 aa  47.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  25.2 
 
 		 350 aa  47.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.89 
 
 		 406 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  30.23 
 
 		 343 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.28 
 
 		 406 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.28 
 
 		 406 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.28 
 
 		 406 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.32 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.28 
 
 		 406 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.26 
 
 		 348 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.26 
 
 		 348 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  22.6 
 
 		 381 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0928  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 		 337 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 		 337 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2273  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 		 337 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 		 337 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3552  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 		 337 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.26 
 
 		 360 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  28 
 
 		 337 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  28 
 
 		 337 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.15 
 
 		 402 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.26 
 
 		 348 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.26 
 
 		 348 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.82 
 
 		 435 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.52 
 
 		 359 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>