98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1029 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1029  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
134 aa  277  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
339 aa  253  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
339 aa  253  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
339 aa  253  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
339 aa  253  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.57 
 
 
360 aa  179  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.57 
 
 
360 aa  179  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.57 
 
 
360 aa  179  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0277  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.41 
 
 
336 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1576  hypothetical protein  54.74 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246651  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  33.33 
 
 
349 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  31.62 
 
 
349 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  31.71 
 
 
260 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  30.77 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  31.09 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  31.01 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  31.01 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  31.09 
 
 
377 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  31.09 
 
 
397 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  31.09 
 
 
377 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  31.09 
 
 
377 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  31.09 
 
 
377 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02815  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06781  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01474  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  30.77 
 
 
347 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  30.77 
 
 
347 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  30.77 
 
 
347 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  29.91 
 
 
347 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5379  putative transposase for insertion sequence element  29.57 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.3 
 
 
342 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.3 
 
 
342 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.3 
 
 
342 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.97 
 
 
347 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.97 
 
 
347 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  32.73 
 
 
385 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 
347 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  33.64 
 
 
385 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2393  ISGsu5, transposase, truncation  33.82 
 
 
198 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.32 
 
 
347 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.32 
 
 
347 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00628  ISGsu4, transposase  26.85 
 
 
238 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000155742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  26.85 
 
 
329 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.22 
 
 
350 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  22.22 
 
 
350 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  26.85 
 
 
344 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2031  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
343 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3529  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.27 
 
 
341 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458804  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2599  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.27 
 
 
341 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.77 
 
 
348 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.1 
 
 
542 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.1 
 
 
540 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.1 
 
 
540 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.1 
 
 
540 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.77 
 
 
348 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.47 
 
 
340 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.47 
 
 
340 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.42 
 
 
348 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.42 
 
 
348 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02021  hypothetical protein  34.43 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  26.27 
 
 
406 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  26.27 
 
 
406 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.7 
 
 
378 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3153  hypothetical protein  26.96 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.740304  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.09 
 
 
347 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30 
 
 
406 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  27.78 
 
 
343 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.14 
 
 
348 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.14 
 
 
348 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.7 
 
 
378 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  27.78 
 
 
343 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  28.83 
 
 
401 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.88 
 
 
360 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0024  transposase  31.86 
 
 
454 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4491  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  30.91 
 
 
403 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5958  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  30.91 
 
 
403 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369394  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3864  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.34 
 
 
412 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00632164  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5232  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.34 
 
 
412 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5286  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.34 
 
 
412 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  25.93 
 
 
266 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  35.34 
 
 
412 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>