More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1662 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.24 
 
 		 347 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.14 
 
 		 347 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.27 
 
 		 347 aa  707    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 347 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.24 
 
 		 347 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  71.59 
 
 		 347 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  71.59 
 
 		 347 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  71.59 
 
 		 347 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  71.3 
 
 		 347 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  64.13 
 
 		 329 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  52.6 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  52.6 
 
 		 377 aa  394  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  52.6 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  52.6 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  52.6 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  51.73 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  52.31 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  52.02 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  50.87 
 
 		 349 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  52.17 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  52.17 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01474  hypothetical protein  65.37 
 
 		 207 aa  292  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06783  hypothetical protein  69.65 
 
 		 209 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02817  hypothetical protein  68.78 
 
 		 209 aa  285  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00546  transposase  69.15 
 
 		 209 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00628  ISGsu4, transposase  55.79 
 
 		 238 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000155742  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06775  hypothetical protein  67.16 
 
 		 206 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06781  hypothetical protein  74.15 
 
 		 147 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02815  hypothetical protein  74.15 
 
 		 147 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0576  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.69 
 
 		 263 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525286  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06439  hypothetical protein  84.17 
 
 		 122 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05058  hypothetical protein  84.17 
 
 		 122 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02808  hypothetical protein  84.17 
 
 		 122 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  57.93 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01473  hypothetical protein  85.19 
 
 		 110 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.84 
 
 		 360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.84 
 
 		 360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.84 
 
 		 360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.85 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.85 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.85 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.85 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0277  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.2 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01463  hypothetical protein  80.43 
 
 		 93 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02021  hypothetical protein  76.47 
 
 		 85 aa  146  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  30 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  30.29 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2393  ISGsu5, transposase, truncation  50 
 
 		 198 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02604  hypothetical protein  66.67 
 
 		 94 aa  96.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.19 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.2 
 
 		 540 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.2 
 
 		 540 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.2 
 
 		 540 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.2 
 
 		 542 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.25 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.25 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  26.05 
 
 		 414 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.26 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  25.94 
 
 		 414 aa  86.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.96 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  26.78 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  26.78 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  26.78 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  26.78 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  26.78 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  26.78 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  26.78 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  26.78 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.28 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.28 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  27.05 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.03 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.93 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.93 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.58 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  23.41 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  23.41 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  23.41 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  23.41 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  23.41 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  23.41 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.58 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  25.29 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  24.25 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  24.25 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.34 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  27.09 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  27.09 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3377  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.33 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3378  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.33 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.195678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3403  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.33 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0158163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3441  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.33 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.33 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.33 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>