130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01463 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01463  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  190  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00546  transposase  96.74 
 
 
209 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02808  hypothetical protein  97.83 
 
 
122 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02817  hypothetical protein  96.74 
 
 
209 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05058  hypothetical protein  97.83 
 
 
122 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06439  hypothetical protein  97.83 
 
 
122 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06783  hypothetical protein  96.74 
 
 
209 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  96.74 
 
 
347 aa  184  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  96.74 
 
 
347 aa  184  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  96.74 
 
 
347 aa  184  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  96.74 
 
 
347 aa  184  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06775  hypothetical protein  94.57 
 
 
206 aa  180  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01473  hypothetical protein  96.25 
 
 
110 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.43 
 
 
347 aa  154  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.43 
 
 
347 aa  154  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.43 
 
 
347 aa  154  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.35 
 
 
347 aa  153  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.35 
 
 
347 aa  153  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  77.17 
 
 
329 aa  151  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  66.3 
 
 
377 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  66.3 
 
 
397 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  66.3 
 
 
377 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  66.3 
 
 
377 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  65.22 
 
 
377 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  65.22 
 
 
377 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  57.61 
 
 
349 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  57.61 
 
 
349 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  58.43 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  64.04 
 
 
260 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  57.78 
 
 
348 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  57.78 
 
 
348 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0277  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.89 
 
 
336 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.65 
 
 
339 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.65 
 
 
339 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.65 
 
 
339 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.65 
 
 
339 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0576  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.55 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.16 
 
 
360 aa  68.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.16 
 
 
360 aa  68.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.16 
 
 
360 aa  68.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00628  ISGsu4, transposase  77.78 
 
 
238 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000155742  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  33.72 
 
 
385 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.71 
 
 
420 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.71 
 
 
420 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3921  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.71 
 
 
420 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.174408  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4655  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.71 
 
 
420 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119916  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.71 
 
 
420 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.78 
 
 
406 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.78 
 
 
406 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.78 
 
 
406 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.78 
 
 
406 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  34.52 
 
 
406 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  34.52 
 
 
406 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  40 
 
 
385 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0645  transposase  38.67 
 
 
249 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2757  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.95 
 
 
316 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000451562  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.95 
 
 
316 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.175769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2778  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.95 
 
 
316 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.335835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
348 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.95 
 
 
317 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0218502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.92 
 
 
342 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.92 
 
 
342 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.92 
 
 
342 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.15 
 
 
316 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.334176  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.15 
 
 
316 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.144178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0736  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.95 
 
 
317 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000627011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2345  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.15 
 
 
316 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.15 
 
 
316 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  31.18 
 
 
414 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.9 
 
 
399 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.67 
 
 
345 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.07 
 
 
466 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12205  transposase  30.53 
 
 
221 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12452  transposase  30.53 
 
 
333 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.267636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1287  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.07 
 
 
465 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324635  normal  0.577676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1282  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.07 
 
 
466 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124375  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.07 
 
 
466 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.425839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.07 
 
 
466 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2232  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.07 
 
 
466 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000585875  normal  0.443218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.07 
 
 
466 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.198929  normal  0.0124292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4398  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.07 
 
 
466 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2973  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.07 
 
 
466 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0717724  normal  0.0172565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.07 
 
 
466 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  40.68 
 
 
418 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  40.68 
 
 
418 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.84 
 
 
402 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.24 
 
 
412 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.24 
 
 
412 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.24 
 
 
444 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2366  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.24 
 
 
412 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  40.68 
 
 
394 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2031  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.41 
 
 
343 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6871  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.9 
 
 
334 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.9 
 
 
334 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410361  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.11 
 
 
378 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.35 
 
 
427 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1828  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.35 
 
 
403 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3521  hypothetical protein  29.35 
 
 
403 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880505 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3558  hypothetical protein  29.35 
 
 
403 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.71 
 
 
411 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>