More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00546 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00546  transposase  100 
 
 		 209 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06783  hypothetical protein  99.04 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02817  hypothetical protein  98.09 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  98.53 
 
 		 347 aa  417  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  98.53 
 
 		 347 aa  417  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  98.53 
 
 		 347 aa  417  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  98.53 
 
 		 347 aa  417  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06775  hypothetical protein  98.03 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.15 
 
 		 347 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.15 
 
 		 347 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.15 
 
 		 347 aa  285  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.15 
 
 		 347 aa  285  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  68.66 
 
 		 347 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  62.02 
 
 		 329 aa  265  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05058  hypothetical protein  98.36 
 
 		 122 aa  250  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06439  hypothetical protein  98.36 
 
 		 122 aa  250  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02808  hypothetical protein  98.36 
 
 		 122 aa  250  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01473  hypothetical protein  99.09 
 
 		 110 aa  228  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  47.26 
 
 		 377 aa  204  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  47.26 
 
 		 377 aa  204  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  47.26 
 
 		 397 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  47.26 
 
 		 377 aa  203  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  46.77 
 
 		 377 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  47.78 
 
 		 349 aa  201  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.77 
 
 		 377 aa  201  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  44.83 
 
 		 349 aa  191  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  44.83 
 
 		 349 aa  191  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01463  hypothetical protein  96.74 
 
 		 93 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  45.54 
 
 		 348 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  45.54 
 
 		 348 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0576  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.8 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525286  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01474  hypothetical protein  96.88 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  58.33 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0277  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.83 
 
 		 336 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02807  hypothetical protein  92.73 
 
 		 59 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01464  hypothetical protein  92.73 
 
 		 59 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06438  hypothetical protein  92.73 
 
 		 59 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05059  hypothetical protein  92.73 
 
 		 59 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00628  ISGsu4, transposase  46.96 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000155742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.75 
 
 		 339 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.75 
 
 		 339 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.75 
 
 		 339 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.75 
 
 		 339 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.51 
 
 		 360 aa  97.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.51 
 
 		 360 aa  97.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.51 
 
 		 360 aa  97.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  27.72 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 		 328 aa  68.2  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 		 542 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  26.63 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1384  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149924  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1339  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.93 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2757  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.84 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000451562  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.84 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.175769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2778  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.84 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.335835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  30.07 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  27.72 
 
 		 385 aa  65.1  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.72 
 
 		 326 aa  64.7  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.18 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.18 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.18 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.34 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  36.84 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  36.84 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  36.84 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  36.84 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  36.84 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  36.84 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  36.84 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.18 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  36.84 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.18 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.18 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.78 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  27.78 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0736  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.84 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000627011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.84 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0218502  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  27.72 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.52 
 
 		 316 aa  62  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.334176  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.52 
 
 		 316 aa  62  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.144178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.52 
 
 		 316 aa  62  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  28.03 
 
 		 406 aa  61.6  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  28.03 
 
 		 406 aa  61.6  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0645  transposase  33.86 
 
 		 249 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.74 
 
 		 406 aa  61.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3378  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.41 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.195678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3403  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.41 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0158163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3441  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.41 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.41 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.41 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>