More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1485 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
339 aa  701    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
339 aa  701    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
339 aa  701    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
339 aa  701    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.01 
 
 
360 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.01 
 
 
360 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.01 
 
 
360 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0277  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.36 
 
 
336 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1029  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
134 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  32.14 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  31.34 
 
 
349 aa  182  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  32.35 
 
 
347 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  32.35 
 
 
347 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  32.35 
 
 
347 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  33.14 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  33.14 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  31.04 
 
 
349 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  32.06 
 
 
347 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  32.84 
 
 
397 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  32.84 
 
 
377 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  32.54 
 
 
377 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.54 
 
 
377 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  33.24 
 
 
348 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  33.24 
 
 
348 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.85 
 
 
347 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.56 
 
 
347 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.37 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.37 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  29.97 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.26 
 
 
347 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.85 
 
 
342 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.85 
 
 
342 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.85 
 
 
342 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1576  hypothetical protein  54.74 
 
 
97 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246651  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  28.99 
 
 
385 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  29.09 
 
 
385 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02817  hypothetical protein  44.35 
 
 
209 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06783  hypothetical protein  44.35 
 
 
209 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00546  transposase  42.75 
 
 
209 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02808  hypothetical protein  46.61 
 
 
122 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05058  hypothetical protein  46.61 
 
 
122 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06439  hypothetical protein  46.61 
 
 
122 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06775  hypothetical protein  43.55 
 
 
206 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.43 
 
 
542 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.43 
 
 
540 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.43 
 
 
540 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.43 
 
 
540 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  34.11 
 
 
260 aa  92.4  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00628  ISGsu4, transposase  27.04 
 
 
238 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000155742  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4650  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.01 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.01 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.01 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467502  normal  0.925611 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4334  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.01 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 
342 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000117153  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01474  hypothetical protein  31.17 
 
 
207 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01473  hypothetical protein  44.34 
 
 
110 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1525  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.01 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.554146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  23.29 
 
 
406 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  23.29 
 
 
406 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02815  hypothetical protein  32.82 
 
 
147 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06781  hypothetical protein  32.82 
 
 
147 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.98 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  24.26 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  23.28 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  26.37 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  26.37 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  26.37 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.55 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  26.37 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  26.37 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  26.37 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  26.37 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  26.37 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01463  hypothetical protein  45.65 
 
 
93 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.99 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.99 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5379  putative transposase for insertion sequence element  28.08 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.54 
 
 
406 aa  79.3  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.72 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  26.65 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.03 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  24.01 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  24.01 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.03 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.03 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  24.01 
 
 
412 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.62 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  23.81 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.81 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.81 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.81 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.81 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.81 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.5 
 
 
408 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2599  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.58 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3187  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  26.16 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3529  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.58 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458804  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2031  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.04 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>